Alors qu'il est pourchassé par un vaisseau cardassien, un petit vaisseau du Maquis disparaît mystérieusement dans une région appelée Badlands, avec à son bord un agent de Starfleet infiltré. La Fédération affrète un nouveau vaisseau, l'USS Voyager, de classe Intrepid, sous le commandement du capitaine Janeway, pour retrouver ce vaisseau et ses occupants. En arrivant dans les Badlands, le Voyager et frappé par un rayon inconnu et se retrouve catapulté dans le quadrant Delta, à 70000 années-lumière de l'espace de la Fédération. Le vaisseau est endommagé et le médecin de bord, tué, est remplacé par le médecin holographique d'urgence. L'équipage découvre alors une étrange entité, appelée le Pourvoyeur, qui déclare veiller sur une planète entière, et retrouve le vaisseau disparu du Maquis. Le Pourvoyeur, très âgé, ne va pas tarder à mourir, et cherche quelqu'un pour prendre sa suite...

Le Voyager répond à un signal de détresse à peine audible et se retrouve prisonnier d'un phénomène étrange qui dédouble le vaisseau. Le capitaine Janeway se rend alors compte que le signal de détresse avait été envoyé par le Voyager lui-même.

Le Voyager est frappé par une onde de choc due à une énorme explosion sur une planète proche du vaisseau. Pour enquêter sur cette explosion, Janeway et Paris se téléportent sur la planète et découvrent que toute vie a disparu. Ils découvrent également de petites failles temporelles et se trouvent alors accidentellement projetés quelques temps en arrière sur la planète, juste avant son explosion.

Alors qu'il croit avoir découvert une planète inoffensive riche en cristaux de dilithium, l'équipage du Voyager est attaqué par deux extra-terrestres qui volent les poumons de Neelix. Les habitants de cette planète, les Viidiens, doivent en effet remplacer régulièrement leurs organes, détruits par une maladie.

Le Voyager a pénétré à l'intérieur d'une nébuleuse pour y trouver du carburant et utilisent une torpille pour en sortir. L'équipage se rend alors compte que la nébuleuse est, en fait, un être vivant blessé par la torpille qu'ils doivent maintenant soigner.

Les instruments du Voyager détectent un trou de ver qui débouche dans le quadrant Alpha. Malheureusement, de Trou de Vers ne mesure que 30 centimètres de rayon. Ils arrivent cependant à y faire pénétrer une sonde qui leur permet d'entrer en contact avec un vaisseau romulien en mission de l'autre coté du trou.

Alors qu'il visite une planète le lieutenant Paris est accusé d'un meurtre qu'il n'a pas commis. Sa punition est de revivre toutes les 14 heures le meurtre par les yeux de la victime. Pour vérifier sa culpabilité, Tuvok utilise sa technique vulcaine de fusion mentale pour enquêter sur le meurtre.

Alors qu'ils explorent une planète inconnue, les membres d'équipage découvrent que cette planète est le cimetière d'une civilisation située dans une dimension parallèle. Les morts y sont téléportés, laissant croire aux habitants qu'il y a une vie après la mort. L'arrivée accidentelle de Kim, ramené sur la planète par le téléporteur funéraire, bouleverse ces croyances.

L'équipage du Voyager rencontre une nouvelle race très hospitalière : les Sikarians. Très avancés spirituellement et technologiquement, les Sikarians tiennent pour une grande richesse les histoires de chaque individu. Ils possèdent également une technologie capable de plier l'espace pour voyager à des dizaines de milliers d'années-lumière en un instant. Malheureusement, ils ont aussi leur équivalent de la Directive Première, qui leur interdit de partager cette technologie avec une civilisation qui n'est pas à leur niveau. Certains membres de l'équipage décident de se servir...

Répondant à un signal de détresse Kazon, l'équipage du Voyager découvre que le vaisseau Kazon a été endommagé à cause de la mauvaise utilisation de la technologie de la Fédération: c'est la preuve qu'un membre d'équipage du Voyager a trahi l'équipage en livrant aux Kazons de la technologie du Voyager.

Un membre d'équipage semble avoir disparu dans un programme médiéval, absorbé par une créature du programme. Du fait de sa nature holographique, c'est le Docteur qui est envoyé pour cette mission dans le Holodeck du vaisseau.

Tuvok et Chakotay reviennent blessés d'une mission de routine. Gravement atteint, Chakotay perd son énergie neurale lorsque leur navette traverse une Nébuleuse Noire. S'il ne revient pas à temps dans cette nébuleuse, il risque terminer sa vie à l'état de légume. Alors qu'il tente de le ramener, l'équipage du Voyager s'aperçoit qu'une créature tente de le manipuler.

Dans leur effort pour trouver un remède contre la maladie qui tue leurs organes, des Viidiens (cf. "Phage") enlèvent le lieutenant Paris ainsi que B'Elanna Torres. Celle-ci, mi- Klingonne, mi-Humaine est séparée artificiellement en deux personnes distinctes: une Klingonne et une Humaine.

Ma'bor Jetrel, un scientifique Haakonien, est en visite sur le Voyager. Il est l'inventeur de la "Cascade Metreon", l'arme qui a annihilé la majeure partie de la race de Neelix, dont la famille de ce dernier. Il annonce à Neelix qu'il ressentira bientôt les effets de cette arme, effets qui seront fatals. Neelix ne le croit pas.

À bord du Voyager, certains membres du Maquis violent les règlements de la Fédération. Tuvok se charge de les éduquer. Dans le même temps, un virus attaque les circuits de transmission bio-neuronaux du vaisseau. B'Elanna Torres et le Docteur tentent d'enrayer la maladie.

Le Voyager repère un S.O.S. en morse en provenance d'une planète de classe L. Ils découvrent alors de vieilles unités cryogéniques contenant huit Terriens. L'équipage décide de les réveiller. Peu de temps après, un groupe d'habitant locaux prend contact et apprend au capitaine que ces terriens, qu'ils croyaient morts, sont les derniers vestiges d'un groupe de plus de 300 terriens capturés en 1937 par les Briari pour en faire des esclaves. Les esclaves se sont révoltés contre les Briari, les ont tués et ont développé une culture Terrienne sur cette planète. Le capitaine Janeway offre alors à l'équipage la possibilité d'y rester.

Le commandant Chakotay embarque seul sur une navette du Voyager afin d'y célébrer la cérémonie indienne rituelle du Pakra. Au cours de la cérémonie, la navette dérive dans la territoire des Kazons. Il est alors attaqué et pourchassé par un jeune guerrier Kazon qui espère se faire un nom en éliminant un membre de la Fédération.

Le Docteur est réactivé dans une infirmerie totalement vide tout comme le Voyager. Il se met à ressentir la douleur et son tricordeur médical lui indique qu'il est humain. De plus, les quelques membres d'équipage qu'il rencontre ne semblent être que des hologrammes. Apparaît alors le lieutenant Reginald Barclay (TNG) qui lui dit qu'il est en fait le vrai docteur Zimmerman piégé dans une simulation holographique impossible à arrêter qu'il a conçue pour étudier le comportement psychologique d'un équipage perdu loin de la Terre.

Une forme de vie inconnue entoure le Voyager et crée un champ électrophorétique. Ce champ a pour effet d'accélérer le métabolisme de Kes, provoquant son entrée dans le cycle de reproduction Ocampa. Or, les Ocampas ne peuvent se reproduire qu'une seule fois dans leur vie. Si Kes veut un enfant, elle doit donc l'avoir tout de suite.

Harry Kim se réveille dans son appartement de San Francisco auprès de sa fiancée Libby. Il est ingénieur spécialisé à Starfleet. Consultant son dossier, il apprend qu'il n'a jamais été affecté à l'USS Voyager.

Un phénomène de distorsion spatiale atteint le Voyager, agissant à la fois autour et dans le vaisseau. Ce phénomène déforme et change la structure du vaisseau, ce qui le désactive complètement. L'équipage fait tout son possible pour sortir de cette situation.

Parce que Kes et Tom Paris passent tout leur temps libre ensemble, Neelix, fou de jalousie, provoque Paris et se bat avec lui. En réprimande, le capitaine les envoie ensemble dans une navette vers une planète de classe M pour ravitailler le vaisseau en nourriture. Peu de temps après, la navette subit des interférences et s'écrase sur la planète.

Alors qu'il se prépare à rencontrer une espèce inconnue (les Bothans), l'équipage du Voyager tombe sous l'influence d'un champ psionique qui leur fait vivre les situations les plus étranges. Le vaisseau est désactivé. Seuls le Docteur et Kes ne sont pas atteints et tentent de sauver le vaisseau.

Chakotay dirige une équipe de recherche en quête de minéraux sur une lune. Ils découvrent alors un village peuplé d'anciens Indiens. Cette rencontre rappelle à Chakotay ses 15 ans et son refus d'embrasser les traditions de son peuple.

Un fragment du Pourvoyeur, conservé à bord du Voyager, entre en résonance. Janeway pense que cette résonance est une communication avec l'autre pourvoyeur présent dans le quadrant Delta. Ils repèrent à proximité du point de communication une station spatiale qui est remplie d'Ocampas. Tanis, leur chef, monte à bord du Voyager pour les aider à contacter le Pourvoyeur. Il décide d'aider Kes à développer ses pouvoirs psychiques.

Des Kazons parviennent à aborder le Voyager et à voler un module de contrôle du téléporteur. Ce succès permet au chef Kazon de persuader les sectes rivales de se joindre à lui contre la Fédération. Chakotay découvre alors que c'est un membre d'équipage du Voyager, Seska, qui a tout manigancé (cf. "State of Flux").

Alors qu'ils recherchent du Tellarium pour le vaisseau, Janeway, Tuvok, Torres et Neelix se téléportent dans une ville Alsaurian, occupée par les Mokra. Ceux-ci font prisonnier Tuvok et Torres. Janeway est, de son côté, retenue par Caylem, un excentrique qui voit en elle sa fille disparue.

L'équipage découvre dans l'espace un androïde désactivé. Après que B'Elanna Torres l'ait remis en marche, celui-ci demande à Torres de construire un prototype qui fabriquerait des androïdes en série. Conformément à la Prime Directive, Torres refuse, jusqu'à ce que l'androïde prenne le Voyager en otage.

Une violente attaque des Kazons endommage le Voyager et provoque la mort d'un membre d'équipage. Chakotay demande alors à Janeway de se comporter plus comme des membres du Maquis que comme des officiers de Starfleet. A regret, celle-ci accepte et tente de former une alliance avec des factions rivales des Kazons. Cependant, à cause des renseignements qu'un membre d'équipage fourni aux Kazons (cf. "Prototype"), la conférence risque d'échouer.

Le lieutenant Tom Paris est le premier à réussir un vol Transwarp, atteignant et dépassant Warp 10. Au retour de sa navette, il est la victime de troubles biochimiques. Ses membranes cellulaires se dégradent et malgré tous les efforts du Docteur, il meurt. Plusieurs heures plus tard, il est retrouvé vivant mais il subit des transformations, devenant un être mi-humain, mi-amphibien. Pendant ce temps, le traître continue de renseigner Seska et les Kazons (cf. "Prototype").

Un membre d'équipage est assassiné et, à la suite de l'enquête, Tuvok découvre que le coupable est un membre d'équipage du nom de Suder. Après que celui-ci ait tout avoué, Tuvok essaie de comprendre les motifs du crime et pour cela, opère une fusion mentale avec lui. Il se met ensuite à avoir des envies de meurtre de plus en plus fortes sans pouvoir réfréner ce sentiment.

Le Voyager repère un missile automatique d'origine Cardassian. Ce missile se dirige vers une planète habitée. B'Elanna Torres se rappelle alors que c'est elle qui a saboté ce missile Cardassian pour qu'il se retourne contre ses concepteurs. Le seul moyen d'arrêter cette arme est de se téléporter à l'intérieur. Torres se porte volontaire.

Un membre du Continuum Q rebelle échappe à la prison et demande asile à bord du Voyager. Q arrive alors à son tour sur le vaisseau et demande l'extradition du rebelle. Un procès s'engage alors et voit s'opposer le rebelle, défendu par Tuvok et Q, qui produit le commandeur William Riker comme témoin.

Le Voyager reçoit un signal de détresse d'un vaisseau inconnu. L'équipage téléporte alors à bord une femme viidienne, Demora, en piètre condition physique. Atteinte du stade ultime de sa maladie, elle nit, en attendant mieux, dans un corps holographique confectionné par le Docteur, qui tombe peu à peu amoureux de sa patiente. Pendant ce temps, Tom Paris se conduit de plus en plus violemment et attaque Chakotay. Le capitaine le fait arrêter. Le membre d'équipage qui renseigne les Kazons reçoit de nouveaux ordres et se prépare à mener le Voyager vers un piège.

Neelix s'entraîne au journalisme à bord du vaisseau. De son côté, Tom Paris quitte Voyager pour piloter un convoi talaxien, conséquence inévitable de son insubordination. Immédiatement, l'alliance Kazon-Nistrim, sous la direction de Seska, attaque le convoi et capture Paris dans l'intention de lui soutirer des informations. Pendant ce temps, Neelix remarque qu'un autre membre d'équipage est probablement en contact avec les Kazons. Toutes les pistes semblent mener à Tom Paris...

Le Voyager entre dans un nuage de plasma, poursuivi par des vaisseaux viidiens. Brutalement, les moteurs tombent en panne, l'énergie baisse et des explosions de protoniques se produisent à l'extérieur du vaisseau. Les pertes sont très graves quand le capitaine Janeway voit apparaître un second Voyager. Visiblement, le Voyager tout entier et son équipage ont été dupliqués.

Une navette transportant Tuvok et Bennett s'écrase sur une planète sacrée pour les Drayans. Seul Tuvok survit au crash et prend contact avec trois enfants Drayans, qui lui disent avoir été exilés et qui demandent à Tuvok de les protéger contre le Morrok, le messager de la mort.

Le Voyager reçoit un signal de détresse automatique d'un camp de Kohls qui n'ont réussi à survivre à une catastrophe environnementale qu'en se mettant en état d'hibernation. Leurs conditions d'hibernation sont contrôlées par un ordinateur qui leur a créé un monde onirique et qui surveille leurs pensées. L'équipage du Voyager décide de réveiller les Kohls mais les personnages du monde onirique refusent de les laisser partir de peur de disparaître.

À la suite d'un accident de téléporteur, Neelix et Tuvok se matérialisent sur le vaisseau en une seule personne, Tuvix, qui est la symbiose entre les deux membres d'équipage. Cet état semble permanent, étant donné la profondeur de la fusion, l'équipage accepte peu à peu ce nouveau membre. Lorsque, plus tard, le Docteur trouve le moyen de re-séparer les deux personnes, Tuvix refuse car cela signifierait sa propre mort.

Chakotay et Janeway ont été piqués par un insecte et attrapent un virus qui les condamne tous les deux. Janeway laisse alors le commandement du vaisseau à Tuvok et se retire avec Chakotay sur une planète dont l'atmosphère inhibe les effets du virus. Malgré les rapports tendus entre les Viidians et le Voyager, le Docteur parvient brièvement à contacter son ancien amour: Demora.

Dans un message de détresse, Seska annonce à Chakotay que leur fils a été exclu par Culluh (un kazon) sur une planète d'esclaves. Chakotay hésite à partir à sa recherche car il sent qu'il a été manipulé. L'équipage détecte alors un signal de détresse d'une navette Kazon et y trouve Teirna, l'ancienne aide de Seska qui déclare que Seska a été tuée par Culluh. Le Voyager se lance alors dans une mission de sauvetage et livre une terrible bataille contre les Kazons, bataille perdue d'avance. A l'issue du combat, le capitaine doit se rendre et abandonner le vaisseau aux Kazons.

Le capitaine et l'équipage du Voyager ont été abandonnés sur la planète primitive Hanon IV et tentent de survivre. Kes est enlevée et Chakotay et Tuvok organisent une opération de sauvetage. Pendant ce temps, Culluh, à la tête du Voyager, entreprend de conquérir et soumettre tout le Quadrant Delta. Alors que Culluh teste la puissance du Voyager, Seska active le Docteur holographique qui lui apprend d'étranges choses à propos de son bébé. Le Docteur détecte également la présence cachée de Suder (cf. "Meld") et apprend également que Tom Paris, à bord d'une navette du convoi Talaxian (cf. "Investigations") tente de venir à leur secours.

Tuvok est en proie à une vision. Dans cette vision, il se voit enfant tenter de sauver une petite fille d'une chute mortelle et échouer. Il semblerait que ce soit un souvenir refoulé or, pour les vulcains, un souvenir refoulé qui tente de réapparaître peut-être dangereux.

Le lieutenant Tom Paris et l'enseigne Harry Kim se retrouvent prisonniers d'une prison acrytirienne. Ils sont accusés d'un attentat terroriste ayant fait 47 morts. Tandis qu'ils cherchent à s'évader, le capitaine Catherine Janeway, à bord du Voyager, enquête pour prouver leur innocence.

Le Voyager se retrouve par mégarde près du territoire d'une espèce insectoïde n'entretenant aucune relation avec les autres au point que leur traducteur universel ne fonctionne pas. Parallèlement, le docteur est en proie à une dégénérescence de ces réseaux mémoriels.

Durant sa route vers le Quadrant Alpha le Voyager tombe sur les traces d'un vortex aléatoire et aussi sur des traces d'utilisation d'un objet de la Fédération. Il s'agit d'un synthétiseur. Après une courte enquête ils se rendent compte qu'il s'agit de deux Ferengis égarés dans ce système.

Alors que le Voyager transporte une délégation Enharane (une race Extra-Terrestre rencontrée dans le cadran) B'Elanna Tores a des rêves érotiques très réels, et de son coté l’enseigne Harry Kim Commence à nouer une romance avec une Enharienne.

Le capitaine Janeway doit subir un rituel rigoureux afin de sauver la vie de Kes.

Une faille temporelle s'ouvre devant le voyager. Un vaisseau de la fédération du XXIXe siècle en sort. Il a pour mission de détruire le Voyager, responsable de la disparition du système solaire survenue au XXIXe siècle. Le Voyager tente de se défendre...

Le Voyager de retour dans le quadran Alpha est piégé dans le XXe siècle (1996). Un vaisseau temporelle du XXIXe siècle est depuis 30 ans aux mains d'une multinationale qui utilise sa technologie pour révolutionner le domaine de l'informatique et attaquer le Voyager...

Un étranger blessé nommé Tieran transfère sa conscience dans l'esprit de Kes juste avant qu'il ne meure. Il gagne alors le contrôle sur elle et commence à utiliser ses capacités pour voler une navette et retourner dans son monde natal pour tenter un coup d’état politique.

Alors que Voyager rencontre plusieurs explosions de Supernova, Q apparaît sur le pont du vaisseau et annonce au capitaine Janeway qu'il veut qu'elle soit la mère de son enfant afin de donner un nouvel élan à son peuple, divisé depuis la guerre civile au sein du Q-Continuum. La situation se complique avec l'arrivée d'une femme Q jalouse

De retour d'une mission diplomatique, Janeway et Neelix retrouvent Voyager entièrement désert. Ils découvrent bientôt que le navire est infesté par un virus géant qui a paralysé l'équipage. Neelix est atteint à son tour

Arrivant dans une région de l'espace qu'il ne connait pas, Neelix, de peur de se faire débarquer du Voyager, cherche à se procurer des cartes par tous les moyens et se retrouve impliquer par un de ses anciens amis, Wixiban, dans un trafic de substances illicites

Harry demande à Tuvok de lui apprendre à contrôler ses émotions lorsqu'il tombe amoureux d'un personnage du Holodeck. Mais il devient vite jaloux lorsqu'il découvre ce dernier en compagnie du personnage qui semble tenter de le séduire...

Une navette transportant Chakotay et Janeway s'écrase sur une planète inconnue. L'événement se reproduit plusieurs fois. La première : seule Janeway est grièvement blessée; la seconde : ils sont attaqués par des Vidiians. Et la troisième fois, l'esprit du père de Janeway apparaît au capitaine pour lui annoncer une mauvaise nouvelle

L'enseigne Vorik entre dans le cycle du Pon Farr et doit absolument se trouver une femme. Il jette son dévolu sur B'Elanna Torres qu'il tente de séduire par contact télépathique forcé. Parallèlement, Voyager est placé en orbite afin de récupérer une substance présente dans les grottes d'une planète. Peu après, Janeway découvre le cadavre d'un Borg dans une des excavations

Lors d'une mission sur une planète habitée par des colons en guerre, Chakotay est recueilli par un groupe mené par une humaine, Riley, qui lui explique qu'elle veut réunifier les colons dans un nouveau collectif semblable à celui des Borgs

Le Docteur a décidé d'intégrer des éléments psychologiques des plus grandes personnalités de l'Histoire (de la galaxie) mais cela tourne mal lorsque une deuxième personnalité issue de son "côté obscur" émerge et prend le dessus. Kes demande à quitter le Voyager lorsqu'elle croise une race explorant l'univers

En détruisant un astéroïde qui menaçait une planète habitée par les Nezus, Voyager provoque de terribles tempêtes de sable. Neelix et Tuvok sont dépêchés pour aider les colons à partir. Cependant, leur navette s'écrase

Harry Kim expérimente une bizarre impression de déjà-vu dans une partie de l'espace qui lui est inconnue. Il apprend peu après qu'il n'est pas humain mais qu'il est originaire de cette région

Alors que Kes vit ses derniers instants, elle se retrouve propulsée à différents moments de son existence...

Alors que l'équipage de Voyager se concentre sur un phénomène de tornades spatiales, le docteur a décidé de créer une famille holographique. Insatisfaite par le perfectionnisme du docteur, B'Elanna lui propose d'introduire des données aléatoires dans le programme.

Le scientifique Voth cherche à prouver que sa race aurait pour origine la Terre et qu'elle aurait migré vers le Quadrant Delta des millions d'années plus tôt. Son gouvernement n'est pas prêt à accepter ses conclusions. Il envoie donc son assistant Veer à la recherche du mystérieux USS Voyager dont il a entendu parler...

Les membres de l'équipage se volatilisent les uns après les autres, remplacés par des Nyrians qui ne semblent pas comprendre ce qui leur arrive. Les disparitions se poursuivent et, soudain, les Nyrians s'emparent du Voyager...

Une mutinerie semble avoir éclaté à bord du Voyager entre les membres de Starfleet et ceux du Maquis. La situation empire et Torres se décide alors à arrêter la simulation. Cependant, Paris et Torres se retrouvent prisonniers de la simulation.

Avec beaucoup d'appréhension, le vaisseau Voyager pénètre sur le territoire Borg pour découvrir qu'il existe une menace encore plus importante que les Borgs eux-mêmes...

L'équipage du Voyager fait un compromis avec les Borgs : une arme sera développée pour vaincre l'espèce 8472, à condition que le Voyager traverse leur territoire en toute sécurité.

Ses pouvoirs de télékinésie progressent à tel point que Kes ne parvient plus à les contrôler. Afin d'éviter une catastrophe, elle doit alors quitter le vaisseau.

Tandis que B'Elanna et Tom sont en exploration à l'extérieur du vaisseau, le Voyager est attaqué. B'Elanna et Tom partent alors à la dérive dans l'espace. Se croyant condamnée à mourir, B'Elanna avoue à Tom les sentiments qu'elle éprouve à son égard.

La navette de Chakotay s'écrase sur une planète, et l'ancien maquisard se retrouve au milieu d'un conflit qui oppose deux espèces qui mènent une guerre totale.

Seven et Harry unissent leurs compétences pour travailler dans le nouveau laboratoire. Durant son travail, Seven interprète le comportement de Harry comme une invitation. Parallèlement, lors d'une mission de sauvetage, Torres se retrouve piégée par un hologramme psychopathe...

Croyant être contactée par les Borgs, Seven quitte le Voyager. Plus tard, elle découvre les débris d'un vaisseau qu'elle a jadis connu. Cet événement fait ressurgir de mauvais souvenirs pour Seven, qui se retrouve confrontée aux souvenirs de son assimilation...

Le Voyager est envahi par une race d'aliens qui entreprend des expériences dangereuses. Par la suite, les membres de l'équipage souffrent de maladies des plus étranges. Seven semble être la seule à pouvoir les sauver...

Avec son vaisseau temporel, Annorax change le cours du temps pour restaurer la grandeur des Krenims. Mais ces ruptures du continuum espace-temps ont des répercussions à grande échelle et affectent même le Voyager. Alors que le navire est quasiment détruit, le capitaine Janeway fait évacuer l'équipage.

Paris et Chakotay tentent de raisonner Annorax, et de ramener, d'une manière ou d'une autre, le Voyager sur la route du quadrant Alpha. Pendant ce temps, à bord du vaisseau de la Fédération, les officiers supérieurs, restés à bord, tentent eux aussi de remettre le navire en état pour pouvoir récupérer l'équipage et reprendre leur chemin.

Une étude est lancée sur une planète habitée par une espèce télépathique. Cette dernière condamne toutes les personnes ayant des pensées malsaines et des actions violentes. C'est alors que B'Elanna est arrêtée pour avoir exprimé un sentiment de vengeance...

Une partie du matériel du Voyager a été dérobé par un transporteur. Kathryn Janeway et Tuvok se lancent alors à la poursuite des voleurs et tentent de découvrir leur lieu de résidence. Afin d'y parvenir, ils obtiennent l'aide de l'hologramme du mentor de Kathryn : Leonard de Vinci.

Neelix est tué au cours d'une mission. Utilisant la technologie des Borgs, Seven fait le ramène à la vie. Mais Neelix commence alors à douter des croyances spirituelles qui lui ont été inculquées, à savoir qu'il existe une vie après la mort...

Le capitaine Janeway et son équipe sont attaqués par des aliens qui hantent les rêves des Humains. Grand connaisseur de l'état de rêve, Chakotay fait tout son possible pour sauver le vaisseau et son équipage.

L'équipage du Voyager fait la découverte d'un relais de communication et tente de joindre un vaisseau de Startfleet. Cependant cela échoue. La seule solution envisagée est d'utiliser Prometheus, un prototype aux capacités tactiques avancées, que les Romuliens sont très désireux d'examiner...

Grâce aux relais de communication, Startfleet envoie des messages au Voyager. Les membres de l'équipage reçoivent alors des nouvelles de leurs proches. Parallèlement, ces derniers vont rencontrer de nouveaux ennemis, les Hirogènes, des chasseurs dont ils sont la prochaine cible.

Malgré lui, le vaisseau Voyager se retrouve au milieu d'un sombre jeu mortel, lancé entre les Hirogènes, un chasseur et sa proie.

Seven cherche à améliorer le système du Voyager. Pour cela, elle se procure de nouvelles armes auprès d'un marchand, Kovin, et lui demande son aide pour l'installation de l'équipement. Plus tard, elle prétend que Kovin l'a agressée...

Le capitaine Janeway, Torres, Tuvok et Seven sont piégés dans un monde imaginaire qu'ils pensent être réel. Ces derniers deviennent alors membres de la résistance française durant la Seconde Guerre mondiale. Afin de les aider à s'échapper de leurs rêves, le Docteur tente de neutraliser les dispositifs.

Soutenu par son équipe, le capitaine Janeway entreprend de vaincre les Hirogènes et de récupérer leur vaisseau.

Un alien, capable de permuter les corps, cherche à échapper à la justice. Il réclame alors de l'aide auprès de l'équipe du Voyager, mais celle-ci refuse. Bientôt, le fugitif prend possession du corps de Tom...

Les membres de Voyager découvrent, à bord du vaisseau, une particule dangereuse et puissante, baptisée Oméga. Selon les directives de Starfleet, la particule doit être détruite au plus vite...

Une jeune femme, Kellin, demande asile à bord du Voyager. Par la suite, elle annonce qu'elle fut passagère sur ce vaisseau, un mois auparavant, et qu'elle est tombée amoureuse de Chakotay. Pourtant, ni lui, ni le reste de l'équipage ne se souviennent d'elle...

Le Docteur doit défendre l'équipage et rétablir la vérité et l'Histoire lorsque, 700 ans dans le futur, une race extraterrestre affirme que le vaisseau de combat Voyager est à l'origine des crimes de guerre commis contre eux.

Kim et Tom découvrent une planète ayant les réserves suffisantes pour réapprovisionner le Voyager. Équipés de leurs tenues d'exploration, ils se rendent sur place pour en récupérer. Bientôt, ces derniers sont retrouvés par leurs confrères, sans combinaison et incapable de supporter l'atmosphère du vaisseau...

Le Voyager rencontre une zone radioactive mortelle. Les membres contaminés sont placés dans une chambre de décontamination. Accompagné de Seven et du docteur, le capitaine Janeway tente de sauver le vaisseau. Bientôt, Seven est en proie à des hallucinations et doit faire face à ses craintes les plus profondes...

Un traducteur étranger, nommé Arturis, parvient à déchiffrer le message envoyé par Starfleet cinq mois auparavant. D'après la traduction d'Arturis, un nouveau vaisseau les attendrait. Il posséderait un moteur plus puissant et pourrait les ramener chez eux dans les trois mois...

L'USS Voyager traverse une région complètement dépourvue d'étoiles. Le capitaine Janeway commence à douter de la pertinence des décisions qu'elle a prises au cours de ces dernières années.

Un accident survenu pendant le processus de téléportation engendre la création d'un super Borg.

Le lieutenant Paris met au point une navette d'un nouveau genre, le Delta Flyer, pour récupérer une sonde qui s'est égarée dans un univers toxique. Pendant ce temps, Torres prend des risques inconsidérés, ce qui ne manque pas d'inquiéter ses collègues.

L'équipe de l'USS Voyager découvre que la Terre est en danger. Des extraterrestres, capables de prendre l'apparence d'êtres humains grâce à une drogue, préparent une offensive de grande envergure.

L'équipage recherche le Delta Flyer, qui s'est écrasé sur une planète inconnue avec à son bord Tom Paris, Tuvok et Samantha. Neelix prend donc sous son aile Naomi, la fille de Samantha. Apprenant que cette dernière est grièvement blessée, il ne sait pas comment annoncer la douloureuse nouvelle à l'enfant.

Le Voyager inaugure un nouveau mode de propulsion qui lui permettra de rentrer sur Terre plus rapidement. Mais l'expérience tourne mal : le vaisseau s'écrase sur une planète couverte par les glaces. Quinze ans plus tard, Chakotay et Kim, seuls survivants de la tragédie, utilisent le Delta Flyer pour envoyer un message dans le temps et ainsi éviter la catastrophe.

Seven fait la découverte d'une pièce Borg appelée le vinculum, qui a pour fonction de relier tous les esprits Borg entre eux. Elle assimile donc plusieurs personnalités, mais ne parvient pas à en garder le contrôle.

Lorsque Torres est attaquée par une forme de vie extraterrestre qui s'implante dans son système nerveux, le Docteur utilise un hologramme pour l'en débarrasser. Or cet hologramme a été créé par un ancien criminel de guerre, dans des conditions très éloignées de l'éthique médicale...

Après avoir désobéi au capitaine Janeway, le lieutenant Paris est condamné à trente jours de cellule et rétrogradé au rang d'enseigne. Il profite de cette période d'isolement forcé pour raconter les événements qui l'ont mené en prison dans une lettre à son père.

Le capitaine Janeway accueille à bord de l'USS Voyager deux familles d'aliens en fuite. Le vaisseau est ensuite intercepté par un escadron Devore à leur recherche. C'est alors que Kashyk, l'officier à la tête de l'escadron, demande à son tour l'asile à Janeway.

Le Docteur a la désagréable surprise de constater que sa mémoire à court terme a été effacée, et que certains éléments de son programme ont été modifiés. Il met tout en œuvre pour retrouver le coupable, mais lorsqu'il découvre son identité le résultat de ses recherches le déstabilise...

Des aliens prennent les personnages du roman holographique du lieutenant Paris pour des êtres qui existent vraiment. Du coup, le capitaine Janeway vient à la rescousse des créatures holographiques.+

Une navette transportant Tuvok, Paris et le docteur finit par s'écraser sur une planète désertique, attiré par sa grande force de gravité. Le temps s'y écoule différemment. Tandis que les naufragés ont l'impression d'attendre d'être secourus depuis des semaines, il ne s'est passé que quelques heures pour les membres de l'équipage.

La découverte d'un vortex menant directement à la terre réjouit tout l'équipage. Seul Seven of nine ne semble pas convaincue par ce passage. Elle a raison. En l'empruntant, l'USS Voyager se retrouve piégé dans une créature qui dévore les vaisseaux.

Après avoir vaincu un vaisseau Borg, le capitaine Janeway décide de faire main basse sur leur technologie afin que l'USS Voyager regagne la terre plus rapidement. Seven of nine est prise en otage par les Borgs, qui ont percé à jour les plans de Janeway.

Harry Kim rencontre Tal, qui appartient au peuple Varro, et entame une relation avec elle, sans aucune autorisation médicale. Des problèmes surviennent lorsque les deux amoureux deviennent chimiquement dépendants l'un de l'autre.

Alors que Tom et Elena viennent de se marier, les membres de l'équipage est frappé par une étrange maladie, qui les désintègrent peu à peu.

Le vaisseau se retrouve coincé dans l'Espace chaotique, où les lois de la physique sont dans un état d'instabilité constante. Chakotay est victime d'hallucinations, qui se manifestent sous la forme d'un match de boxe.

L'USS Voyager tombe dans une embuscade tendue par les Hazari. En échange de leur libération, ils exigent qu'on leur livre Seven of nine.

L'USS Voyager intercepte un cargo Malon endommagé. A bord, une fuite de gaz toxique menace une planète proche, aussi le lieutenant Torres envoie−t−il rapidement une équipe afin de la réparer.

Le docteur tente d'apprendre à Seven of nine le concept du rendez-vous galant. Mais au fur et à mesure des leçons, il se rend compte qu'il est train de tomber amoureux d'elle.

Le capitaine Janeway raconte l'histoire d'une de ses ancêtres, première d'une longue lignée d'exploratrices, Shannon O'Donnell. Elle fut à l’initiative d'un projet de pont qui permit de relier la terre à sa première colonie, la planète Mars.

Cet épisode retrace le premier jour de Janeway à bord de l'USS Voyager jusqu'à la destruction du vaisseau. Braxton demande à Seven of nine de l'aider à découvrir ce qui s'est passé afin d'éviter la catastrophe.

Après avoir reçu un signal de détresse émanant d'un missile extra−terrestre, Kim, Torres et le docteur découvrent qu'il s'agit en réalité d'une arme de destruction massive.

L'USS Voyager croise sur sa route un autre vaisseau de la Fédération en piteux état, l’Équinoxe. Le capitaine Janeway se prend de sympathie pour Rudy Ransom, le commandant de bord. Elle va l'aider à sauver son vaisseau afin qu'ils puissent faire route ensemble vers la terre.

Le capitaine Janeway veut capturer le capitain Ransom à tout prix, alors que l'USS Voyager est attaqué par des aliens et que le docteur et Seven of Nine sont retenus à bord de l'Equinox.

Seven of Nine est confrontée à son passé. Elle découvre qu'elle est responsable de l'assimilation de trois Borgs, qui veulent récupérer leur identité.

B'Elanna frôle la mort à bord du vaisseau fantôme klingon, qui transporte les âmes déshonorées à Grethnor. Au péril de sa vie, elle décide d'y retourner pour sauver l'âme de sa mère.

Le docteur expérimente un nouveau programme lui permettant de rêver éveillé. Lorsqu'un espion extra−terrestre surgit dans une de ses visions, il les confond avec la réalité.

Tom Paris persuade Chakotay d'acheter une navette venant d'un dépotoir. Pendant la réparation, la navette, nommé « Alice », commence à prendre le contrôle de l'esprit de Tom.

Tuvok est attaqué par une source d'énergie qui provoque des dommages dans son cerveau. Il commence alors à éprouver des émotions qu'il n'avait jamais ressenties auparavant.

L'USS Voyager est assiégé par les Turrei et trouve refuge à proximité d'une planète inconnue. Le capitaine Janeway cherche alors à conclure une alliance avec les Vaadwaur, les habitants de cette planète. Mais elle réalise bientôt que ces derniers pourraient être encore plus dangereux que les Turrei.

L'USS Voyager est suivie par une sonde qui a disparu alors qu'elle se rendait sur Mars.. au XXIe siècle.

L'équipage découvre une race d'extra-terrestres possédant une technologie qui permettrait de rentrer sur Terre plus rapidement.

Le lieutenant Reginald Barclay s'obstine à trouver un moyen de communiquer avec le Voyager, perdu dans le Quadrant Delta. C'est ainsi qu'il crée un micro-vortex artificiel.

L'équipage profite du tout nouveau holoprogramme créé par Tom, qui les projette dans un petit village irlandais appelé Fair Haven. Le capitaine Janeway en pince d'ailleurs pour un des personnages virtuels.

L'USS Voyager se retrouve en orbite autour d'une planète où le temps s'écoule plus rapidement que dans le reste de la galaxie.

Lorsqu'une nouvelle race d'extra-terrestres découvre les talents de chanteur du docteur, ce dernier devient une véritable star sur leur planète. Il envisage alors de démissionner afin de se consacrer pleinement à ses millions de fans.

Les membres de l'équipage vivent une expérience étrange : ils se remémorent une bataille contre un ennemi qu'ils n'ont jamais rencontré.

Seven est contrainte de prendre part à un combat à mort pour que Tuvok, blessé lors du crash de la navette, reçoive les soins nécessaires à sa survie.

Chakotay, Harry Kim, Neelix et Tom Paris sont kidnappés par de jeunes drones Borgs rejetés par le Collectif car ils ne respectent pas les «normes» borgs.

Les personnages de la ville-hologramme irlandaise créée par Tom attribuent à l'équipage des pouvoirs divins lorsqu'ils les voient utiliser la technologie futuriste de la Fédération.

L'enseigne Lindsay Ballard revient à bord du Voyager alors qu'elle a été tuée quelques mois auparavant au cours d'une mission. Les kobalis, une race d'extra-terrestres dont le seul moyen de se reproduire est de ressusciter les morts, l'ont ramenée à la vie et en ont fait une des leurs.

Les parents d'Icheb, une jeune Borg, viennent réclamer leur fils à bord du Voyager. Seven of Nine découvrent qu'ils ont l'intention de se servir de lui pour se venger des Borgs, dut-il en mourir...

Le capitaine Janeway emmène trois membres d'équipages, dont les résultats ont été désastreux aux dernières évaluations, en mission à bord du Delta Flyer afin de les remettre à niveau. Une collision avec une comète les met dans une situation périlleuse.

Des escrocs se font passer pour le capitaine Janeway et de son équipage. Ces derniers doivent impérativement les retrouver sous peine d'être accusés de leurs crimes à leur place.

Un poète extra-terrestre découvre B'Elanna Torres inconsciente après le crash du Delta Flyer. Avant de la laisser partir, il décide d'en faire sa muse afin de regagner les faveurs de son seigneur de guerre.

Kes revient à bord du Voyager, en colère contre le Capitaine Janeway qu'elle estime responsable de ses échecs passés. Pour se venger, elle utilise ses pouvoirs pour voyager dans le temps et livrer ainsi l'équipage aux Viidiens.

Le Voyager reçoit de très mauvaises nouvelles : le professeur Lewis Zimmerman, le créateur du docteur, est gravement malade. Pour sauver la vie de son «père», ce dernier est envoyé dans le Quadrant Alpha.

Alors que le Voyager rencontre des problèmes techniques. Neelix distrait les enfants Borgs en leur racontant ce qui est arrivé à l'équipage quelques mois auparavant avec le fantôme du pont 12.

Seven of Nine est conduite dans une zone appelée «Unimatrix zero», où les Borgs existent en tant qu'individus à part entière. Cependant, cet espace ne leur est accessible qu'au cours de leur régénération.

L'équipage de l'USS Voyager parvient à infiltrer la communauté Borg afin de la neutraliser. Mais la reine Borg veille et ne tarde pas à entrer en contact télépathique avec Tuvok pour stopper les plans du capitaine Janeway.

Les implants de Seven of Nine connaissent de graves dysfonctionnements. Seule une greffe d'implants d'un Borg vivant pourrait la sauver. Icheb, l'enfant Borg du vaisseau, se porte candidat mais l'opération est susceptible de les tuer tous les deux.

Paris et Kim s'apprêtent à participer à une course spatiale qui verra s'affronter quatre races en guerre. Cette compétition est censée être un premier pas vers la paix mais en coulisses, meurtres et sabotages se multiplient.

L'équipage de l'USS Voyager est victime de mystérieuses agressions. Tabor puis Yasa ont été attaqués et retrouvés inconscients. Tuvok soupçonne un membre de l'équipage d'être responsable de ces malveillances.

Gar enlève le docteur et le force à travailler dans un hôpital où les patients reçoivent des soins en fonction de leur statut social. L'équipage du capitaine Janeway part à sa recherche.

Un hologramme du docteur Reginald Barclay apparaît à bord du Voyager. Il annonce à l'équipage que la Fédération a trouvé un moyen de créer un passage qui ramènera le vaisseau sur Terre. Le capitaine Janeway et le docteur estiment que ce procédé comporte trop de risques pour être tenté.

A bord du Delta Flyer, le docteur, Kim et Seven of Nine sont attaqués par un navire Lokkirim, qui les accuse de transporter un hologramme, un crime aux yeux de leur législation. Afin de le préserver, Seven cache le programme holographique du docteur dans ses circuits.

A bord du Delta Flyer Harry, Kim, Seven of Nine et Neelix, sont à la recherche de dilithium pour réparer l'USS Voyager endommagé. Ils reçoivent soudain un appel de détresse d'un vaisseau Kraylor. Un navire Annari, peuple ennemi des Kraylor, leur intime de ne pas leur porter secours mais ils décident d'ignorer cet ordre.

Une race supérieure d'hologrammes est née des manipulations des Hirogens et s'est rebellée contre ses créateurs. Le capitaine Janeway et ses hommes s'allient aux Hirogens quand les hologrammes enlèvent le Docteur.

Une race supérieure d'hologrammes est née des manipulations des Hirogens et s'est rebellée contre ses créateurs. Le capitaine Janeway et ses hommes s'allient aux Hirogens quand les hologrammes enlèvent le Docteur.

L'USS Voyager est frappé par des vagues de distorsion temporelle qui le font voyager dans le temps. Seul Chakotay est immunisé contre le phénomène. Il met cette capacité à profit en aidant l'équipage à revenir dans le présent.

Torres ne se sent pas bien. Le docteur l'examine et lui apprend qu'elle est enceinte et que l'apparence de l'enfant est majoritairement klingon. Torres se souvient alors des brimades subies dans son enfance dues à sa propre apparence klingon.

L'USS Voyager vient en aide à un vaisseau Nygean en perdition, qui transporte des prisonniers Benkarans. Neelix comprend rapidement que le seul tort des prisonniers est d'être d'une autre race que celle de leurs geôliers. Il fait part de cette découverte à Paris et Torres.

Un vaisseau Klingon entre en contact avec l'USS Voyager. Le capitaine Kohlar, invité à monter à bord par le capitaine Janeway, y rencontre Torres. Il est alors persuadé que l'enfant que porte cette dernière est celui annoncé dans une ancienne prophétie Klingon.

L'USS Voyager est happé dans un vide spatial. A l'intérieur de cette zone, des vaisseaux se livrent une guerre sans merci pour récupérer vivres et énergie. Le capitaine Janeway et son équipage entrent dans cette course à la survie tout en cherchant un moyen de s'évader.

De retour de mission, Chakotay, Kim et Neelix découvrent l'USS Voyager totalement déserté à l'exception du docteur. Celui-ci leur explique que l'équipage est tombé dans un piège et a été capturé. Il se trouve actuellement sur la planète Quarra et n'a plus de souvenir de son passé.

Sur la planète Quarra, Chakotay tente de faire recouvrir la mémoire aux membres de l'USS Voyager, mais il est à son tour capturé et subit un lavage de cerveau.

Seven of Nine passe de plus en plus de temps à perfectionner ses connaissances sur les humains. Obsédée par sa vie holographique, elle néglige le vaisseau en grand danger.

Q confie son fils Q2 aux bons soins du capitaine Janeway. Il espère que celle-ci parviendra à le discipliner. Mais Q2, rebelle dans l'âme, multiplie les provocations et met l'équipage dans de délicates situations.

Le docteur de l'USS Voyager a décidé de publier un holo-roman racontant le calvaire d'un docteur dans un navire perdu dans l'espace. Le reste de l'équipage voit d'un mauvais œil son interprétation de leur vie quotidienne.

L'USS Voyager a pour mission de retrouver une sonde lancée par les Terriens au 21è siècle. L'équipage la localise sur une planète et est frappé par ses effets dévastateurs sur la population locale.

Chakotay et Seven of Nine s'écrasent sur une planète primitive. Ils font la connaissance des peuples qui l'habitent, les Ventu. L'USS Voyager ne peut leur venir en aide car une barrière d'énergie l'empêche de se poser.

L'USS Voyager entre en contact avec des Talaxian en conflit avec une colonie minière. Neelix hésite à rejoindre définitivement son peuple ou rester à bord du vaisseau.

A bord du Delta Flyer, Janeway et le docteur sont attaqués par des aliens. Le capitaine est capturé. Le docteur, s'il veut la revoir vivante, va devoir se plier aux ordres des extra-terrestres et prendre l'apparence de divers membres du Voyager.

Voila dix ans que l'USS Voyager est rentré sur Terre. Pour célébrer l'événement, une fête est organisée. L'amiral Janeway retrouve ses anciens collègues puis s'éclipse. Elle prépare une nouvelle mission qui pourrait remettre en cause tout leur périple passé. L'amiral Janeway est partie dans le passé. Elle se retrouve dans l'USS Voyager et explique au jeune capitaine Janeway quel destin attend l'équipage. Elle se propose de l'aider, mais la reine Borg intercepte leur conversation.