À bord du module 77 du JIOR Sphere 01, Haruto Tokishima perd un concours de restauration face à Shōko Sashinami pour l'utilisation de leur terrain d'école alors qu'à leur insu, cinq agents dorsiens infiltrés infiltrent le lycée Sakimori. Quelque temps plus tard, alors que les agents explorent l'école pour une destination, l'un d'eux a une brève altercation avec Haruto sur leurs différentes visions du monde. Ensuite, les agents dorssiens s'infiltrent et tuent les scientifiques dans un laboratoire secret sous l'école bien qu'un scientifique blessé éjecte leur cible principale, un mecha géant appelé Valvrave 01 à la surface de l'école.

Kyūma Inuzuka, Aina Sakurai et Saki Rukino arrivent à l'emplacement de Valvrave pour trouver un Haruto et un L-elf inconscients. Alors que les autres agents dorssiens arrivent, L-elf trahit apparemment ses camarades et aide les étudiants à fuir. Ensuite, alors que les forces dorssiennes occupent le module 77, Haruto convainc ses amis qu'il avait en quelque sorte possédé le corps de L-elf et a repris plus tard le Valvrave, tout en réussissant également à retourner dans son propre corps avec l'aide de Saki. Alors que le Valvrave s'active et attaque le vaisseau Dorssian à proximité, il se retrouve projeté à l'extérieur du module dans l'espace. A-drei et Q-vier utilisent alors Dorssia Ideal Mechs pour attaquer le Valvrave 01 tout en croyant que L-elf les a trahis.

Les forces ARUS appréhendent L-elf alors qu'il transmet une étrange chaîne de mots à Haruto. Alors que les forces de l'ARUS et le sénateur Figaro apportent un soulagement aux étudiants de l'Académie Sakimori, Haruto et ses amis essaient et échouent à déduire la nature de ses nouvelles capacités. Par la suite, Figaro envoie un mot pour rencontrer Haruto et l'exhorte à devenir un symbole d'espoir dans la guerre contre Dorssia. Pendant ce temps, alors que L-elf s'échappe de sa captivité, Cain envoie A-drei, X-eins, H-neun et Q-vier dans une autre tentative pour reprendre le module 77.

Le président Jeffrey Anderson et le sénat de l'ARUS votent pour obtenir l'arme JIOR Valvrave pour les aider dans leur campagne contre Dorssia. Pendant ce temps, après avoir rejeté le contrat de L-elf, Haruto ne parvient pas à empêcher Figaro d'expérimenter l'unité 01, entraînant la mort d'un pilote ARUS. La flotte dorssienne effectue alors une première frappe contre le module 77 qui incite Figaro à donner la priorité à sa sécurité par rapport aux étudiants de Sakimori dans une transmission interceptée par Shōko et Akira Renbōkoji. Shōko utilise alors des moyens drastiques pour informer le Conseil étudiant de la trahison de Figaro et tandis que Takahi Ninomiya distrait les représentants de l'ARUS, Shōko, Kyūma et Yūsuke Otamaya sauvent Haruto. Alors que Figaro tente de partir, Haruto apparaît alors et révèle ses véritables intentions au corps étudiant mécréant. Ayant perdu patience, Figaro commence à tirer sur les étudiants jusqu'à ce que Haruto l'arrête avec l'unité 01.

Avec leur chantage tenant les forces ARUS et Dorssian à distance, les étudiants de Sakimori profitent d'une paix hors de propos à bord du module 77, bien qu'ils ne soient pas conscients de sa consommation d'énergie dangereusement élevée. Ailleurs, Dorssian Führer Amadeus K. Dorssia rallie ses forces avec une démonstration de puissance. En explorant les profondeurs du module 77, L-elf fait une découverte lorsque le réseau électrique s'arrête en raison du système météorologique surchargé. Bien qu'il soit enfermé dans le hangar de Valvrave 01, Takumi Kibukawa explique le problème avec Yūsuke étant la seule autre personne à comprendre. Raizō traîne ensuite Yūsuke vers les hauteurs du module pour réinitialiser le système, trouvant finalement l'interrupteur lorsque ce dernier tombe à travers le sol endommagé par la bataille. Le climat froid commence également à atténuer l'esprit des filles Sakimori au point où Takahi et sa clique commencent à blâmer Shōko et Saki.

Malgré la tentative d'Haruto de l'arrêter, Saki monte à bord du Valvrave Four et à sa grande surprise, elle termine avec succès sa procédure de démarrage. Observant secrètement le succès de Saki à piloter le Valvrave Four, L-elf en déduit que l'installation souterraine n'a pas été construite sous Sakimori High par hasard puisque les étudiants répondent à certaines exigences pour faire fonctionner les mechs en les comparant à la tentative ratée du soldat ARUS. Après un peu de virée en voiture, Saki se lamente sur son passé, obligeant Haruto à baisser sa garde et elle le mord, changeant leur conscience. Ensuite, Haruto (Saki) utilise le compte WIRED de Haruto pour aider à renforcer sa propre popularité en tant qu'idole. Lorsqu'elle est confrontée à Haruto, et peu après à Shōko, elle prétend que si elle n'affirme pas son statut d'idole, tout le monde l'oubliera.