Comme les Mutoh vaquent à leurs occupations quotidiennes, une série de puissants tremblements de terre commence à provoquer des destructions massives dans tout le Japon.

Avec la montée des eaux, les Mutoh et leurs voisins Nanami et Haruo décident d'abandonner le sanctuaire où ils se sont réfugiés, et quittent Tokyo.

La tragédie frappe, mais les survivants poursuivent leur chemin vers l'ouest. Kite, un YouTubeur estonien populaire, décide de rejoindre le groupe.

Le groupe s'abrite dans une épicerie, mais les séismes les forcent à continuer. Ils fuient avec le propriétaire, et récupèrent un auto-stoppeur anglais en cours de route.

La communauté de Shan City accueille les voyageurs à bras ouverts. La Mère de la ville communique avec les morts, ce qui crée des tensions entre Ayumu et sa maman.

Kunio est fait prisonnier après la tentative d'évasion. Ayumu s'aperçoit que le vieil homme utilise le morse pour essayer de transmettre un avertissement désespéré.

Les survivants atteignent un port où l'évacuation par bateau est en cours, mais seule Ayumu est autorisée à monter à bord grâce à son potentiel athlétique.

L'archipel japonais commence à s'enfoncer. Le groupe s'échappe sur un bateau de pêche, vite endommagé. Tous grimpent dans des canots de sauvetage.

Les survivants du canot retrouvent Kite et Onodera, et localisent les coordonnées d'un centre de recherche qui recèlerait des données pouvant sauver le Japon.

Les données d'Onodera incluent une carte extrêmement surprenante. Le sauvetage des survivants du canot dépend de la reconnexion à la montgolfière de Kite.