Arnaud craint que sa nouvelle institutrice, la petite sœur de Mademoiselle Bille-en-tête, ne révolutionne l'ordre établi dans la classe.

Keesha et ses camarades apprennent à renforcer les décors de leur pièce de théâtre en se rendant sur la montagne la plus venteuse au monde.

Mademoiselle Bille-en-tête emmène la classe à Hawaï, où Véronique se lie d'amitié avec un petit poisson dont la vie est menacée par un redoutable prédateur.

Dans la BD qu'il a réalisée pour la cérémonie d'enfouissement d'une capsule temporelle, Thomas fait s'affronter ses deux héros préférés lors d'un ultime combat.

En se rendant sur une montagne de magnétite, Raphaël et ses amis s'inspirent des électrons contenus dans les aimants pour finaliser leur chorégraphie.

Alors qu'il a décidé de convaincre le directeur d'autoriser sa classe à adopter un petit rongeur, Carlos n'arrive pas à arrêter d'éternuer.

Anne-Sophie utilise l'art animal du camouflage pour tenter de remporter une grande partie de cache-cache organisée à l'école.

Pour remporter un concours d'inventions, Jyoti s'inspire d'une leçon sur l'eau telle qu'elle apparaît sous ses trois formes : solide, liquide et gazeuse.

Lors d'une nouvelle sortie scolaire, les élèves de Mademoiselle Bille-en-tête se rendent dans l'espace. Obsédée par les selfies, Keesha provoque une catastrophe.

Terrorisée à l'idée de parler en public, Anne-Sophie s'inspire d'illustres conteurs et témoins d'innombrables changements survenus sur Terre : les glaciers.

La classe construit un robot géant avec l'aide du Professeur Sarah Bellum avant de s'intéresser au système nerveux de Raphaël.

Arnaud s'intéresse aux sources d'énergie alternatives pour tenter de mettre ses peurs de côté lors d'une nuit à la belle étoile avec sa classe.

Mademoiselle Bille-en-tête transforme le Bus Magique en sous-marin pour emmener la classe dans les profondeurs de l'océan et aider Jyoti à récupérer son médaillon.

Quand la classe est invitée à participer au jeu télévisé préféré de Thomas, le bus ramène le petit groupe au temps de la préhistoire à la découverte des fossiles.

Des griffures sur les murs aux pepperonis manquants sur la pizza, la classe de science est un vrai bazar, et tout semble accuser Martine la Pie, l'oiseau de Véronique.

Véronique a été tellement occupée par la préparation de la fête d'automne qu'elle en a oublié la nourriture ! Son seul espoir repose sur une ferme apparemment hantée.

Mademoiselle Bille-en-Tête et sa classe s'aventurent sur Internet pour retrouver un Arnaud numérisé avant que la grand-mère de Jyoti ne le supprime pour toujours.

Quand Arnaud perd malencontreusement Ratasha, le rat de Carlos, et le rend invisible, les élèves doivent apprendre à voir le monde à travers les yeux d'animaux.

Jyoti et ses camarades apprennent à faire face aux déconvenues en tentant de fabriquer une astromobile capable d'explorer une planète lointaine.

Une course entre Carlos et Mikey entraîne les deux frères et leurs amis au sommet d'une montagne de pâtes où le petit groupe en apprend davantage sur les mécanismes.

En partant à la recherche de la pluie pour tester l'Auto-parapluie, la dernière invention de Jyoti, les élèves se retrouvent pris au piège dans une tempête.

Les mathématiques aident Raphaël à réaliser des calculs complexes en plein vol lorsque ses cousins le recrutent pour leur numéro de cirque aérien.

Raphaël refuse de croire Thomas qui prétend que les arbres peuvent communiquer. Mademoiselle Bille-en-Tête décide alors d'emmener la classe dans la forêt.

Tout le monde fait caca, même les animaux, mais la classe a du mal à croire que cet "or brun" a autant de valeur que le prétend le célèbre oncle d'Anne-Sophie.

Le bus emmène la classe de Mademoiselle Bille-en-Tête dans l'organisme de Janet, la cousine d'Arnaud, pour en apprendre davantage sur les gènes et l'hérédité.

Une excursion au cœur du Soleil prend un tournant inattendu quand Monsieur Réglo, le directeur de l'école, très à cheval sur la sécurité, décide de participer au voyage.