À la cascade de Rozan, le vieux maître se réveille au milieu de la nuit suite à un cauchemar dans lequel Hadès, le Dieu des Enfers, tranche la tête d'Athéna... Il sent que le sceau d'Athéna qui emprisonne les 108 spectres d'Hadès est sur le point de se briser, signifiant ainsi le début d'une nouvelle guerre sainte...

Après avoir utilisé la mort d'une étoile sur Seiya, Mû se retrouve à nouveau face à Masque de Mort et à Aphrodite, mais ceux-ci ne font pas le poids face au chevalier du Bélier et succombent eux aussi à sa puissante attaque... Pendant ce temps, à Rozan, Shiryû doit affronter d'autres adversaires revenus du royaume des morts...

Château de Hadès, en Allemagne... Rhadamante souhaite se rendre lui-même au sanctuaire pour éliminer Athéna, car il ne fait pas confiance aux anciens chevaliers d'Or, mais il en est empêché par Pandore. Pendant ce temps, Mû s'apprête à affronter son premier spectre dans la maison du Taureau...

Alors que Saga, Camus et Shura espéraient traverser la maison des Gémeaux sans problème, ils se retrouvent face à un homme portant l'armure des Gémeaux. Saga envoie Camus et Shura vers la maison suivante et se prépare à affronter l'inconnu. Pendant ce temps, en Sibérie, Hyôga reçoit une visite inattendue...

Saga, Camus et Shura parviennent enfin devant la maison du Cancer. Alors qu'ils la traversent, ils se retrouvent subitement dans un lieu très inhospitalier: les Enfers. De son côté, Shiryû arrive au Sanctuaire, où il est accueilli de façon bien peu amicale par Ikki...

Le combat entre Shion et Dôko vient de commencer. Les deux adversaires sont de même puissance, mais Dôko est désavantagé par son corps miné par l'âge et il se retrouve vite en mauvaise posture. Dans le même temps, Shun et Hyôga arrivent au Sanctuaire. Ils se heurtent à Shina, qui veut les empêcher de passer...

Alors que Mû, à la poursuite des trois ex-chevaliers d'Or, s'apprête à traverser la maison du Cancer, il se retrouve subitement immobilisé par une force psychokinétique très puissante et découvre qu'un groupe de spectres a envahi le sanctuaire. Seiya se joint à la bataille mais il est sur le point de se faire massacrer par Gigant quand un autre spectre intervient : Myû du Papillon...

Les Spectres menés par Gigant sont arrivés à la Maison du Lion, où ils doivent faire face à Aiolia. Celui-ci a vite fait d'éliminer cinq d'entre eux. Alors qu'il s'apprête à combattre les autres, il est retenu par l'intervention de Laimi du Ver...

Saga, Camus et Shura font maintenant face à Shaka. Celui-ci, convaincu qu'ils veulent vraiment tuer Athéna, est résolu à les en empêcher. Ne voulant pas souiller davantage la maison de la Vierge, il les entraîne dans le jardin adjacent et entame avec eux une combat à mort...

Shaka a été frappé de plein fouet par le cri d'Athena lancé par Saga, Shura et Camus. Il se résigne alors à mourir, non sans d'abord envoyer un dernier message à Athéna. Les autres chevaliers d'Or, brisés par le chagrin et furieux, sont bien décidés à le venger...

Athéna lui demande de lui trancher la gorge et l’aide même à accomplir cet acte. En apprenant ceci, Radhamente va immédiatement prévenir sa majesté Pandore qui le puni sévèrement pour avoir envoyé à la mort des spectres au sanctuaire selon les ordres d’Hadès. Enfin, nous retrouvons les chevaliers de bronze sains et saufs pleurant la mort de leur déesse. Ils sont vite rejoints par Sion qui décide enfin de leur dévoiler toute la vérité …

Juste avant qu’ils ne partent, Sion répare leur ancienne armure grâce au sang d’Athéna restant et leur dit que ce sont leur dernière armure. Une fois ceci fait, ils partent au château d’Hadès en suivant le cosmos d’Aiolia et les autres. Entre temps, nous retrouvons Saga, Camus et Shura rapportant la dépouille de la déesse à sa majesté Pandore. Mais ceux-ci ne veulent que présenter le corps défunt au seigneur Hadès...

Dohko et Kanon se préparent donc à rejoindre leurs compagnons de bronze. Enfin, nous voyons Hyoga, Shyriu et Shun s’apprêtant à descendre les escaliers pour rejoindre le royaume des morts entouré d’un cosmos doré signifiant qu’ils ont atteint le 8ème sens, l’Arayashiki. Et l’épisode se termine avec Seiya tombant dans les escaliers menant au royaume des morts, entouré d’un cosmos ailé...

Le château du Seigneur Hadès se dresse sur un piton rocheux qui s'effondre par endroit. Le dôme détruit d'une des tourelles témoigne d'un éboulement dû à la violence de cette bataille. Seiya, tient fermement la statuette pendant qu'il s'enfonce dans le gouffre rejoindre le mondes des morts où Athéna est partie combattre. Investi d'une nouvelle mission, son cosmos brille d'une intensité incroyable guidée par sa volonté farouche.

Shun et Seiya font face à la première prison d'Hadès. Sur la façade, on peut y lire l'épigraphe suivant "la demeure du jugement". Andromède semble interloqué devant le rôle de cette bâtisse. Toutefois, ils s'approchent en direction du propylée de l'édifice...

Dans les enfers, Seiya et Shun arrivent finalement à la 2ème prison. Le garde des enfers, Cerbère, tente d'arrêter Seiya et son compagnon. A l'intérieur de la 2ème prison, un spectre fait son apparition et tente de les arrêter. Ce spectre apparaît sous la forme d'un Sphinx : Pharaon. Cerbère est arrêté par le chevalier d’argent de la Lyre, Orphée, qui fait son apparition. Il était autrefois un chevalier légendaire dont la puissance dépassait même celles des chevaliers d'Or. La mort de sa bien aimée Eurydice, l’a fait revenir dans les enfers avec l’accord d'Hadès. Après avoir été sauvé par cet homme au pouvoir incommensurable, Seiya et Shun découvrent le corps enterré de la belle Eurydice. La pauvre Eurydice a été victime d'un plan mené par le subordonné d'Hadès, Pharaon, pour forcer Orphée à rester dans les enfers.

Orphée a finalement compris son erreur, et décide d'aider les chevaliers d'Athéna dans leurs quêtes. Connaissant la bravoure de ce guerrier légendaire, Pharaon décide donc de provoquer Orphée en duel. Pharaon débute rapidement le combat en jouant de sa harpe démoniaque : un duel entre les 2 hommes a donc lieu, via leurs instruments de musique ...

Comme tous les trois jours, Orphée s'est donc rendu à Guidecca, le palais d'Hadès où Pandora le reçoit comme à l'accoutumée. Accompagné d'un coffre, il suscite la curiosité et la méfiance de Pandora. Protégeant farouchement le dieu des morts, elle finit par faire exploser la charnière et ouvrir le coffre. Des milliers de pétales de fleurs apparaissent. Un doute subsiste encore. Et Pandora plonge son sceptre à l'intérieur à plusieurs reprises. Mais rien. C'est alors que les 3 juges font leur entrée...

Dans la salle du trône au palais de Guidecca, Hadès, réincarné dans le corps de Shun, gît là sans bruit et semble s'être rendormi. Pandora, toujours auprès de lui, panse sa main égratignée par sa faute. Elle se sent terriblement coupable de lui avoir fait cette blessure causée par sa méfiance. Elle est envahie de reproches qui l'assaillent laissant entrevoir les conséquences désastreuses de son geste...

La bataille contre Hadès fait rage. A Giudecca, Hadès est enfin apparu devant Seiya en la personne de Shun. C'est la consternation dans les rangs des chevaliers d'Athéna ! Dès lors, Seiya fût expédié dans le Cocyte, un endroit gelé où règne le vent, et un froid glacial. De leur côté, Shiryu et Hyoga se trouvent dans la 6ème prison et se dirigent vers Giudecca grâce à l'aide de Kanon. Dans la maison précédente, un important combat se livre opposant les juges à Phoenix venu soutenir Kanon revêtu de l'armure des Gémeaux...

Ikki, troublé par l'apparition de Shun, comprend que ce dernier avait volontairement accepté l'âme d'Hadès en lui pour permettre l'anéantissement de l'Empereur des Ténèbres. Le chevalier Phénix explique ensuite à une Pandore incrédule que son jeune frère est fidèle à sa constellation protectrice, Andromède, princesse qui s'offrit en sacrifice pour sauver le monde, ce qui montre bien que Shun n'est pas né pour être Hadès, mais pour être chevalier d'Athéna...

Valentine, qui constate que Seiya est à terre, veut en profiter pour s'emparer de l'armure d'Athéna et la remettre à Pandore, mais le chevalier Pégase, qui n'est pas encore mort, la maintient fermement dans sa main. Le spectre de la Harpie s'acharne alors sur son adversaire, mais le cosmos de ce dernier se met à brûler intensément, d'autant que Seiya entend la voix d'Athéna...

Alors que Seiya est au bord du désespoir, l'image de Marine lui apparaît. La femme chevalier incite son disciple à ne pas perdre courage, et le chevalier Pégase finit par relever la tête, d'autant que l'armure d'Athéna recommence à briller. Il s'en empare, puis quitte le Cocyte...

Les cinq chevaliers d'or présents dans la Giudecca intensifient leur cosmo-énergie, puis projettent les armes de la Balance sur le mur des lamentations. A l'extérieur du palais, Pandore aperçoit la lumière dégagée par la force de l'attaque et comprend ce qui se passe. Cependant, elle estime qu'un tel geste sera inutile... et effectivement, après un court temps de suspense, les armes de la Balance sont renvoyées vers les chevaliers d'or qui sont projetés à terre...

Juste après s'être regroupées dans la Giudecca, les armures des chevaliers d'or défunts se dissocient dans une lumière qui éblouit les chevaliers présents dans la quatrième sphère des enfers. Une fois la lumière dissipée, les chevaliers de bronze et les chevaliers d'or rescapés ont la surprise de voir que tous les chevaliers d'or ont ressuscité ! S'ensuivent des retrouvailles émouvantes entre Aiolia et Aiolos, Hyoga et Camus, Shiryu et Shura, Siya et Aldébaran, ainsi qu'entre Shun et Masque de Mort et Aphrodite...

Grâce à l'aide des 12 chevaliers d'Or, Seiya et ses amis peuvent désormais franchir le mur des Lamentations. Cependant, Shiryuu est contraint de rester en arrière pour protéger leur progression des derniers Spectres encore vivants. Mais un autre problème se présente à eux : derrière le mur se trouve un passage vers une autre dimension, qu'ils ne savent comment franchir...

Pour permettre à Ikki de gagner Elysion, Pandore a choisi de trahir Hadès au prix de sa vie. Pendant ce temps, à Elysion, les Nymphes avertissent Thanatos de l'arrivée d'un homme étrange, couvert de sang...

Seiya n'est pas de taille face à Thanatos, qui ne subit aucune de ses attaques. Pégase réussit pourtant à l'égratigner, ce qui provoque la colère du Dieu de la Mort. Afin de faire payer cet affront au Chevalier, il décide de s'en prendre à sa soeur. En effet, Marine a retrouvé Seika dans un petit village de Grèce, totalement amnésique suite à une chute...

Seiya, Shiryû, Hyôga, Shun et Ikki, désormais recouverts par les armures d'or, entourent un Thanatos complètement perplexe. Comment ces armures ont-elles pu arriver jusqu'à Elysion ? L'aide d'un dieu est indispensable et Athéna est prisonnière d'un charme d'Hypnos...

Après avoir vaincu Thanatos, Seiya court vers le temple d'Hadès, mais un nouvel obstacle apparaît. Hypnos, qui a assisté sans réagir à la mort de son frère, se dresse face à lui. Qu'importe ! Après un bref avertissement, Seiya déclenche ses météores. La tunique du dieu se déchire et son casque se brise, laissant apparaître sur son front la même étoile que Thanatos. Sans prendre la peine de se retourner, Seiya file vers le temple d'Hadès.

Hadès n'est plus qu'à quelques pas de la jarre emprisonnant Athéna. Il lève son épée sur laquelle figurent de nombreuses runes et l'abaisse dans sa direction ! Ikki se jette courageusement pour faire barrage, mais l'épée divine est plus forte. Le regard vide, il s'écroule, tandis qu'une large brèche entame l'indestructible réceptacle...