Inspectrice de police au caractère bien trempé, Harlee Santos n'hésite pas à enfreindre quelques règles pour protéger ses coéquipiers. Mère célibataire, elle considère ses partenaires comme sa seconde famille. Prise en flagrant délit de corruption par le FBI, elle est confrontée lors d'un entretien à l'agent Robert Stahl qui lui propose un marché : fermer les yeux sur son dérapage en échange de sa collaboration en tant qu'informatrice au sein de la brigade anticorruption.

Matt Wozniak est furieux d'apprendre qu'il y a une taupe au sein de son équipe, qui sert d'informateur au FBI. Il soupçonne tous les membres de son groupe. Il confie son désarroi à Santos qui, de son côté, tente de se soustraire à sa mission auprès de Robert Stahl. Pour éloigner les soupçons de son chef, Harlee lui conseille de faire passer toute l'équipe au détecteur de mensonges. De son côté, Carlos Espada soutient du mieux qu'il peut Tess qui a découvert l'infidélité de son mari.

Harlee est arrêtée un matin par des hommes du FBI pour être menée devant l'agente Baker qui a des questions à lui poser sur son supérieur hiérarchique. Wozniak est en effet soupçonné d'accepter des paiements en jetons de casino. L'inspectrice refuse de confirmer ces dires. En revanche, elle accepte d'informer le FBI d'une affaire menée hors des circuits officiels par Tess et Espada. Mais l'enquête se révèle plus complexe qu'elle n'y paraît.

Rongé par la culpabilité et les remords, Michael Loman commence à perdre pied, ce qui inquiète et fragilise l'ensemble de l'équipe. Ses collègues décident de tester sa loyauté de manière brutale. Hospitalisé à la suite d'un accident de voiture, Wozniak donne une mission à Harlee qui se révèle être dangereuse et incriminante. L'inspectrice feint de collaborer avec Stahl mais celui-ci doute de sa sincérité.

A la suite d'une course-poursuite haletante, Harlee et Tess font une importante saisie d'héroïne. La marchandise appartient à Raoul Mendes, un baron de la drogue qui connaît un des secrets les plus intimes de Matt. Donnie reçoit la visite surprise de Robert Stahl qui l'interroge sur Wozniak. Parallèlement, Harlee découvre par inadvertance que Cristina a un petit ami et qu'elle lui ment.

Après que Miguel Zepeda envoie une nouvelle lettre à sa fille, Cristina, Harlee lui rend visite en prison à sa demande. Il est persuadé d'avoir identifié l'homme qui a commis le meurtre pour lequel il est injustement emprisonné. Matt est de son côté persuadé d'avoir identifié la taupe de son équipe : Saperstein. Tess annonce à Carlos qu'elle a l'intention de révéler leur liaison à son mari.

Après sa terrible altercation avec Saperstein qu'il soupçonnait de l'avoir trahi, Wozniak éprouve un profond sentiment de culpabilité. De son côté, Harlee doit répondre aux questions insistantes de Stahl sur le déroulement des événements sur le chantier. Elle décide de couvrir son chef malgré les doutes qui l'assaillent et s'applique à protéger son unité, au bord de l'explosion.

Stahl et son équipe s'interrogent sur les causes exactes de la mort de Saperstein et comptent sur Harlee pour obtenir des aveux de son chef. Toute l'équipe se réunit pour évoquer le décès de son collègue. Wozniak tente d'apaiser les esprits les plus sceptiques tandis qu'Harlee, comprenant qu'il est prêt à tout pour sauver son poste, décide d'aider Stahl dans son enquête. Cristina Santos confie ses problèmes à Tess et Matt.

Après l'émouvant enterrement de Saperstein, Harlee retrouve Stahl à qui elle a promis de l'aide pour faire tomber Matt. Elle retrouve facilement la confiance de son patron et l'accompagne pour la réception d'un colis. Ses investigations mettent au jour la relation secrète qu'entretient Wozniak avec Donnie Pomp. Parallèlement, l'équipe enquête à la suite d'un mystérieux appel téléphonique intercepté sur le poste de Saperstein.

Après avoir découvert la réalité sur la relation qu'entretiennent Wozniak et Donnie, Robert Stahl redouble de détermination pour le confondre. Encore sous le choc, Harlee accompagne son patron lors d'un rendez-vous avec le partenaire de Donnie, qui est agent aux stupéfiants. Miguel Zeppeda sort de prison grâce à un accord passé entre son avocat et le procureur. Il demande à Harlee l'autorisation de rencontrer Cristina.

L'heure du braquage approche et Harlee tente d'obtenir l'immunité pour son équipe en révélant le nom de l'homme à l'origine de cette opération. Mais elle comprend trop tard qu'elle a commis une grave erreur en faisant confiance à Stahl. Miguel Zepeda rencontre en cachette Cristina, qui lui fait des révélations sur le lien qu'entretient sa mère avec Wozniak. Loman assiste malgré lui au braquage orchestré par ses collègues.

Alors qu'ils ont réussi à quitté les lieux du braquage avec l'argent, Harlee et Wozniak sont percutés par une voiture. Lorsqu'ils reprennent connaissance, les billets de banque ont disparu. Matt pense que Donnie les a subtilisés pour régler une importante transaction immobilière. Toujours sur les lieux, Loman est interrogé par le FBI. Se sentant prise au piège, Harlee entre en contact avec l'agent Stahl pour passer un marché avec lui.

Furieuse des nombreux mensonges de sa mère, Cristina se tourne vers son père à qui elle a décidé s'accorder sa confiance. En se rendant chez Wozniak, Loman se retrouve face à Donnie et une violente dispute éclate entre les deux hommes. Lorsqu'il arrive sur place, Matt est contraint de prendre une décision difficile. L'agent Stahl tend un piège à sa coéquipière pour sauver sa carrière.

Harlee Santos n'hésite pas à prendre une série de mesures radicales afin de couvrir le meurtre de Miguel, son ex-mari violent. De son côté, le capitaine Matt Wozniak conclut un accord avec l'agent du FBI Robert Stahl. Il espère ainsi éviter la prison à lui-même et à son équipe, mais il ne tarde pas à comprendre que Stahl l'a conduit tout droit dans un piège inextricable. Alors que l'équipe gère comme elle peut les répercussions du braquage raté, Tess peine à dissimuler sa blessure par balles, qui s'avère très douloureuse...

Wozniak ouvre les hostilités avec Stahl lorsqu'il découvre que la cible de l'agent du FBI est son amie Julia Ayres. Harlee est bouleversée par une affaire en cours...

Face au refus catégorique de coopérer de Wozniak, Stahl n'a d'autre possibilité que de mettre la pression sur Harlee. Pour la jeune femme, c'est le début d'une situation impossible à affronter. Elle apparaît comme intimement liée aux agissements de Wozniak. Or, elle n'ignore pas que pour se débarrasser du FBI, celui-ci n'hésitera pas un seul instant à faire tomber un autre agent. Il ne reculera en effet devant aucune extrémité pour échapper à l'emprise du FBI. Par ailleurs, les enquêteurs des affaires internes ne ménagent pas leurs efforts afin de découvrir ce qui est réellement arrivé à Donnie Pomp. Petit à petit, ils parviennent à resserrer leur étau...

Harlee comprend que Stahl n'arrêtera pas ses investigations avant d'avoir envoyé Julia Ayres en prison. Intriguée, la policière enquête discrètement de son côté pour vérifier si les allégations de collusion avec la mafia émises à l'encontre d'Ayres sont justifiées...

Les dirigeants de la mafia locale semblent plus que jamais déterminés à faire arrêter Harlee pour meurtre. Ils essaient de lui faire porter la responsabilité d'un crime qu'elle n'a - bien sûr - pas commis. Pour se protéger, la policière essaie tant bien que mal d'échapper à ses poursuivants en couvrant ses traces du mieux qu'elle peut. De son côté, Wozniak doit affronter une nouvelle crise qui risque d'ébranler encore un peu plus la cohésion de son équipe. En effet, la découverte d'une preuve concernant un ancien délit met sous pression le groupe déjà malmené. Parallèlement, Stahl parvient à faire ami-ami avec Cristina. Il se rapproche dangereusement de la vérité à propos de Miguel...

Harlee et Wozniak enquêtent sur le meurtre de Caroline, l'ex-compagne de Nava. Cette affaire met Harlee dans l'embarras. Par ailleurs, Wozniak veut découvrir quel membre de son équipe sert d'informateur à Verco...

Après les aveux de Harlee sur sa collaboration avec le FBI, son équipe est abasourdie par sa trahison et celle de Wozniak. Alors que le doute et la suspicion s'installent parmi les policiers, Harlee et Wozniak leur présentent un plan pour neutraliser Bianchi...

Wozniak s'en prend violemment à Bianchi, l'accusant d'avoir rompu leur accord. Harlee tente de ressouder l'équipe en impliquant ses coéquipiers dans une mission illégale au service du frère de l'un d'eux...

Alors que Wozniak enquête sur la disparition d'un enfant, Harlee découvre que quelqu'un se fait passer pour Miguel. L'usurpateur envoie régulièrement des textos à Cristina.

Harlee et Wozniak se lancent dans une chasse à l'homme pour retrouver les tireurs qui ont ciblé leur équipe. Les deux policiers sont également déterminés à trouver la preuve qui leur permettra de faire plonger Bianchi. Alors que l'enquête interne se poursuit, les agents font bloc contre Verco, qui aurait de quoi étayer les accusations de corruption...

Harlee et Wozniak mènent une dangereuse mission pour mettre la main sur la «boîte à secrets» de Bianchi et l'arrêter une bonne fois pour toutes. Mais leur plan prend une tournure tragique quand un de leurs proches est mis en danger, obligeant Harlee à demander de l'aide à celui qu'elle voudrait éviter plus que tout .

Nava découvre une autre facette de la personnalité de Harlee qui le déstabilise. Stahl obtient une information cruciale dans son enquête sur Miguel. Wozniak fait une découverte qui le terrifie...

Wozniak a démasqué la personne qui l'a trahi. De son côté, Stahl pense avoir réuni tous les éléments nécessaires pour faire tomber Harlee pour meurtre. La jeune femme va devoir se battre pied à pied...

Harlee et Wozniak, toujours aux prises avec les conséquences de leurs expériences de mort imminente, découvrent une scène de crime macabre et mystérieuse.

Harlee est en mission pour trouver un niveau de corruption plus élevé au sein du NYPD. Wozniak essaie de protéger son équipe contre les menaces croissantes.

Harlee s'interroge sur sa santé mentale alors que Wozniak garde les secrets de ses proches. Loman intimide un témoin.

Harlee cherche à abattre la cellule de renseignement. L'obsession de Stahl avec Harlee le ramène à New York. Espada lutte pour garder les secrets du tofu.

Harlee découvre que l'implication de la cellule de renseignement dans des entreprises criminelles va plus loin qu'elle ne le pensait. Ramsey riposte. Tufo s'éloigne de l'équipage. Loman rencontre une fille.

Harlee et Wozniak ont ​​24 heures pour relier le service de renseignement au cartel tout en faisant face à la réaction de rupture du mur bleu.

Harlee se bat un travail de cadre alors que Wozniak essaie de garder Bennett derrière les barreaux.

Wozniak demande à l'équipage de faire un geste dangereux contre l'unité de renseignement alors que Harlee a du mal à rester sur sa nouvelle voie.

Harlee découvre une trahison. Cole essaie d'éviter la portée de Ramsey. Wozniak tente de négocier avec la cellule de renseignement.

Harlee fait face à une commission de police alors que Wozniak et l'équipage se bousculent pour l'aider de l'extérieur.