Bumblebee, Sideswipe et Strongarm suivent les conseils donnés par une vision d'Optimus Prime. De la planète Cybertron, ils font face à un nouveau défi : Le vaisseau du Minicon Fixit s'écrase sur Terre, dispersant sur Terre les prisonniers Décepticons à bord (via leur nacelle de stase). Denny et Russell sont un duo père et fils qui vivent dans la ville de "Crown city". Le passe-temps de Danny est de collectionné des machines usagés provenant d'un grand entrepôt de ferraille.

L'équipe de Bumblebee éveille le Dinobot Grimlock qui se bat et bat ko Underbite. Underbite essaye de s'échapper de la ville "Crown City", mais Russell et Sideswipe utilisent une voiture d'aluminium comme appât pour amener Underbite dans une carrière où il est battu en le poussant dans une fosse. L'image d'Optimus Prime apparaît et commande que Bumblebee mène son équipe pour défendre la Terre des nouveaux Décepticons.

Un pétrolier se trouvant près de la ville "Crown City" est attaqué par Hammerstrike. La paranoïa en mers se propage. Bumblebee et Grimlock font équipe pour battre Hammerstrike. Strongarm confronte le reformé Décepticon Grimlock, méfiant de lui, faisant que Grimlock choisi de quitter.

Butch semble avoir volé de l'équipement pour construire un vaisseau spatial pour quitter la Terre, manquant seulement de carburant pour faire fonctionner le vaisseau. Bumblebee se lance pour le capturer. L'aide opportune de Fixit lui permettra de battre Butch.

On découvre une nacelle de stase près du musée d'Histoire naturelle de la ville "Crown City". Denny et Russel, déguisé comme des archéologues et les Autobots en mode voiture, réussissent à obtenir la nacelle. Le taureau Terrashock se libère de la nacelle de stase. L'équipe de Bumblebee est exposée au public pendant le combat, dû à Danny et Russell.

Thunderhoof se fait passer comme un monstre du folklore local connu comme le Kospego et commande à des humains de lui fournir des composants pour construire un Pont Spatial afin de le ramener sur Cybertron. L'activation du Pont Spatial cause des conséquences inattendues, prenant au piège Bumblebee et Sideswipe dans le portail. Thunderhoof est transporté ailleurs et se heurte à Grimlock.

Filch, un Décepticon d'apparence oiseau, est détecté et avec succès capturé par l'équipe de Bumblebee après un peu de difficulté. Le directeur de téléréalité Denny veut avoir une entrevue avec Larry LaRue, un collectionneur antique, mais est rejeté. Strongarm se rend compte que ses coéquipiers sont plus importants que des règles de conduites.

Steeljaw plante secrètement un Nitan, un dispositif semblable au pou, à l'intérieur du corps de Grimlock afin de le contrôler. Grimlock est envoyé pour attaquer un entrepôt de ferraille de voiture et obtient la nacelle de stase d'Underbite. Bumblebee et Sideswipe réussissent à expulser le Nitan et ramener à lui Grimlock. Steeljaw et Underbite réussissent à s'échapper.

Pendant une patrouille seule, Strongarm tombe face à face avec le Décepticon grenouille Springload. Springload croit qu'il est toujours sur Cybertron et cherche la ville légendaire perdue de Doradas. Bumblebee, suivant secrètement Strongarm, l'aide à battre Springload.

L'Autobot Jazz arrive de Cybertron pour examiner l'écrasement du vaisseau prison. Ped, un Décepticon semblable à un ver de terre, creuse les environ près d'un dépôt de ferraille d'auto, à la recherche de cristaux d'Énergon. Les Autobots placent quelques Énergons tout près du signal d'énergie résiduel de la nacelle de stase comme appât, pour appréhender Ped.

Bumblebee, se battant contre Quillfire, est infecté d'une toxine qui rend son intelligence à un niveau enfantin. Quillfire fait évadés des éléphants du zoo mais Bumblebee et Grimlock réussissent à les re-capturer. Bumblebee bat Quillfire et la toxine se dissipe.

Deux vaisseaux de Cybertron atterrit à l'Ouest de la Forêt de la ville "Crown City". Les Autobots pourchassent le Décepticon Fracture. Drift sauve Bumblebee de Fracture, pour laquelle Bumblebee le remercie après la bataille mais Fracture réussit à s'échapper.

Optimus reçoit une formation des Treizes Minicons pour ainsi mieux capturer les Décepticons. Le Décepticon mouffette Stench, avec sa capacité de vaporiser une toxine d'incapacité, apparaît et menant une équipe de 4. Grimlock, Sideswipe et Strongarm succombent à la toxine mais Bumblebee arrive à les sauver. Après la bataille, Bumblebee rappelle aux membres de son équipe la valeur de rester attentif et garder l'unité dans leur mission.

Le Décepticon crabe Clampdown apparaît vers l'immeuble de prévention des inondations de la ville "Crown City". Clampdown essai de persuader d'autres de tenter de découvrir un trésor caché. Pendant le combat, Clampdown est sauvée par Steeljaw et forcée de joindre son armée.

Quand Denny et des robots sont capturés, Russell doit garder son calme afin de protéger l'équipe entière contre un Décepticon qui donne vie aux pires craintes des Autobots.

Quand le dernier entraînement de l'équipe laisse Sideswipe sans force, le jeune Autobot réalise qu'il ne peut pas toujours compter sur sa puissance physique.

Drift revient sur Terre à la poursuite d'un Jetstorm fugitif. Au même moment l'équipe de Bumblebee doit affronter Springload et Quillfire qui se sont échappés.

Ignorant que Grimlock cache une blessure grave, Bumblebee et l'équipe font route vers l'océan à la poursuite d'un Décepticon échappé.

Groundpounder, un ancien gladiateur devenu Decepticon s'échappe et participe à un combat télévisé. Il va devoir affronter Grimlock.

Fixit bugge de plus en plus. Denny essaie de le réparer, mais cela réveille son programme de garde. Armé de tout un arsenal, il tente de s'en prendre aux autres.

Steeljaw et sa bande parviennent à s'introduire dans le dépôt de ferraille pour libérer les Décepticons cryogénisés et à maintenir les Autobots à distance grâce à un champ d'ondes soniques. Nos héros vont devoir faire preuve de ruse pour déjouer leur plan et reprendre le contrôle des lieux.

Grimlock découvre un Dinobot évadé avec qui il sympathise. Il le laisse s'enfuir, mais celui-ci ne tarde pas à tout détruire et à terroriser les humains. Nos héros vont devoir unir leurs forces pour l'arrêter. Denny aménage un camping-car pour Russell qui a peur que son père fasse une déco trop ringarde.

Sideswipe rencontre une Autobot solitaire envoyée en mission par Primus. La nouvelle venue accepte de faire équipe avec la petite troupe de Bumblebee pour affronter une Decepticon qui ressemble fort à une reine des abeilles...

Bumblebee décide de montrer à son équipe les beautés de la planète Terre. Il les emmène dans une ville fantôme du Far West. Mais un Decepticon capable de prendre n'importe quelle forme les y attend...

La menace qui pèse sur la Terre se précise, et les Primes décident d'y envoyer Optimus, même si son entraînement n'est pas encore achevé. Pendant ce temps, la meute de Steeljaw permet à un adversaire particulièrement redoutable d'arriver sur Terre : Mégatronus.

Mégatronus se prépare à réduire la Terre en poussière, mais les qualités de stratège de Bumblebee, le courage et la fidélité de son équipe, assistée d'un Optimus particulièrement puissant, vont avoir raison de lui!

Optimus est affaibli quand Micronus le dépouille soudainement du pouvoir du Primes. Malgré le souci des Autobots pour lui, Optimus insiste de continuer à être utile. Un Decepticon se montre dans le cercle polaire arctique et Optimus, Drift, Windblade et Sideswipe vont à sa rencontre alors que Bumblebee, Strongarm, Fixit et Grimlock restent à la vase et sont pris parn embuscade par un Decepticon nommé Overload, qui a de la rancune contre Optimus pour l'avoir battu il y a plusieurs années.

Bumblebee continue de pourchasser Overload, suivi par Grimlock et Strongarm non trop loin derrière, tandis qu'Optimus et son groupe continuent à poursuivre Polarclaw.

Alors que l'équipe essaye d'appréhender un nouveau Décepticon nommé Saberhorn, Strongarm et Grimlock essayent de recréer le travail d'équipe qu'avait Strongarm avec Sideswipe.

Après une erreur sur le terrain, Strongarm se prend hors de l'action au moment où l'équipe a le plus besoin de son aide contre l'incendie à partir Decepticons Crazybolt et Slicedice.

Windblade est préoccupé par les bien être d'Optimus, mais cela met l'équipe adverse à risque dans leur combat contre un Decepticon.

Cybertronian dans son cerveau, mais quelque chose va mal et laisse l'équipe dans une situation désavantageuse.

L'équipe obtient plus d'indices sur l'île des Décepticons avec Steeljaw qui a un plan intelligent pour infiltrer la cour à scrape. Bumblebee, Grimlock et Strongarm affronteront Scorponok, le chef de l'île.

Bumblebee est persuadé d'aller à un concert sur son groupe musical préféré, il a l'espoir de passer une soirée détendue à l'extérieur de la casse, mais ça devient dangereux quand Bisk attaque le stade.

Grimlock recherche un meilleur camouflage qui est en cours d'exécution à pleine vitesse, quand Quillfire fait son retour. Pendant ce temps, Bumblebee et Strongarm sont coincés dans une fourrière.

Fixit essaye d'effectuer une réparation, mais ça tourne très mal. À la consternation de tous, il convoque deux des plus dangereux Décepticons sur la planète et en outre banni Bumblebee dans une autre dimension.

Slipstream et Jetstorm veulent prouver qu'ils peuvent travailler très efficacement sans les exigences de leur professeur Drift. Involontairement ils exposent Drift au danger. Maintenant ils doivent se précipiter apour le sauver, avant que ce ne soit trop tard.

Après que les deux équipes Autobots soient réunis, aider par un vieil ami, découvrent l'Île des Décepticons. De façon inattendu, ils rencontrent Steeljaw, qui commande une armée de Décepticons.

Les Autobots, étant en infériorité numérique, recherchent désespérément une façon d'arrêter l'avance de Steeljaw et son armée sur l'Île des Décepticons. Mais une tension entre Bumblebee et Optimus pourraient mettre la mission et le monde entier en danger.

Une visite à une vieille base des Autobots (TF Prime), révèle un nouvel ennemi qui suit sa mission.

Une tentative d'impressionner Fixit devient dangereuse quand Strongarm rencontre un autre membre des Scavengers.

Pendant que l'Équipe de Bumblebeee continue leur chasse aux reliques, Grimlock rencontre un nouvel allié surprenant.

Les Scavengers trouvent le Sabre "Dark Star Saber" perdu, dont Starscream est très heureux de mettre la main dessus.

La chasse au Mini-cons est lancés entre les Autobots, les Scavengers et l'équipe de Starscream.

Le destin des Mini-cons repose sur la réussite des Autobots face au nouveau pouvoir de Starscream.