Le matin se lève sur l'un des meilleurs hôpitaux de Copenhague. Le professeur Helmer cherche des noises à son jeune collègue Krogschoy. Le docteur Bondo donne une leçon de dissection à ses étudiants. Mais tout ne va pas si bien. Une rumeur accuse le professeur Helmer d'avoir commis une erreur médicale...

Stig Helmer se met dans tous ses états en apprenant que son patient va être opéré sous hypnose. Pourtant, l'intervention se déroule sans anicroche. Seule bizarrerie : le malade aperçoit une petite fille que personne d'autre ne semble remarquer. De son côté, Judith tombe sous le charme de Krogschoy...

En fouillant les archives de l'hôpital à la recherche du dossier de Mona, les docteurs Helmer et Krogen se rendent compte qu'elles sont écrites en lettres de sang. De son côté, madame Drusse fouille elle aussi dans le passé, mais avec ses propres méthodes, afin d'en savoir plus sur Marie-le-fantôme...

Madame Drusse lève le mystère qui entourait la mort de Mary. Elle connaît désormais l'identité de celui qui se cache derrière ce meurtre odieux, et n'ignore plus rien du mobile. La tumeur progresse à l'intérieur du corps du docteur Bondo. Krogschoy annonce à Rigmor que son amant est parti sans elle à Haïti...

Le professeur Helmer est de retour d'Haïti avec un poison destiné à transformer les patients en zombies. Madame Drusse, qui a libéré l'esprit de Mary, est victime d'un accident de voiture en sortant de l'hôpital. Judith donne naissance à un enfant monstrueux, rejeton du fantôme du docteur Krüger...

A nouveau opérée, madame Drusse lutte contre la mort et retrouve la petite Mary, qui lui révèle que les oiseaux de passage sont des esprits se réunissant régulièrement près du phare. Judith, elle, s'est attachée à son enfant, qui continue de grandir de façon anormale et souffre le martyre...

Le professeur Bondo, après l'avoir examiné en détail, accepte de se débarrasser de son sarcome en se faisant opérer. Moesgaard, pour sa part, semble se détendre un peu au terme de ses séances de psychiatrie. Par ailleurs, Helmer a enfin découvert les circonstances de la disparition du corps de Krogschoy...

Madame Drusse avoue à son fils Bulder qu'il est en réalité le demi-frère du docteur Bondo et démasque l'adepte des messes noires. Helmer surprend une conversation inquiétante : selon Krogschoy, Mona aurait des choses à dire à son sujet. Nivessen, lui, essaie de dissuader le directeur de descendre à la loge...

Une nuit, Karen, somnambule notoire, entend une voix qui l'enjoint de se rendre au Rigshospitalet, l'hôpital le plus important de Copenhague. L'établissement serait hanté par un esprit malveillant. Le lendemain matin, pour sa première journée, le docteur suédois Helmer Jr subit un bizutage en règle.

Sous la houlette du docteur Pontopidan, le Royaume prépare la conférence annuelle sur la gestion de la douleur. Entravée sur son lit, Karen reçoit la visite du Grand Duc, sous l'apparence d'un médecin. Elle ne doit son salut qu'à l'arrivée de Balder. Helmer Jr. découvre l'existence des Suédois anonymes.

Karen pénètre dans les entrailles du Royaume et débouche dans des marécages embrumés. Elle croise surtout le maître des lieux. Helmer a trouvé ce qu'il cherchait mais tombe bientôt sur le docteur Naver ; les choses tournent mal. Naver et Helmer Jr. comparaissent devant un tribunal interne.

Karen tente d'accomplir sa tâche, mais des forces maléfiques contrarient ses desseins. Judith mène l'opération du coeur du Royaume tandis que le docteur Helmer fomente une attaque contre l'hôpital et les Danois. Sa folie le conduit à un point de non-retour. Le docteur Krogshoj revient dans une meilleure version de lui-même, et Judith découvre un objet étrange à la suite de l'opération.

Tapis dans l'ombre, Grand Duc se tient prêt. Anna fait des révélations à Helmer Jr concernant son père. Chez les Suédois anonymes, une véritable arme provoque un accident mortel. Le docteur Pontopidan prononce enfin son grand discours. Pour Karen, le docteur Krogshoj et Balder, le moment est enfin venu de purifier définitivement le Royaume des esprits maléfiques.