Dans le tunnel sous la Manche reliant la France à l’Angleterre, le corps d’une femme est retrouvé à l’emplacement exact de la frontière franco-britannique. Des équipes de police française et anglaise sont dépêchées sur place, dirigées par Elise Wassermann de la police criminelle de Calais et Karl Roebuck, son homologue à Folkestone. La victime est une députée française, Marie Villeneuve. La complexité du meurtre va contraindre les deux services à enquêter ensemble.

Les capitaines Wassermann et Roebuck interrogent le journaliste Danny Hiller après l'incident de la bombe posée dans sa voiture. L'interrogatoire est interrompu par la mise en ligne d'une vidéo du tueur sur Internet, rendant l'affaire du tunnel publique. Le meurtrier est bien décidé à dénoncer la faillite morale de la société moderne. A Folkestone, Suze, la soeur de l'étrange Stephen, subtilise des calmants dans la maison de retraite où elle travaille et, le soir, des portefeuilles dans les bars pour le compte d'Anthony, un maquereau notoire...

Comme annoncé par le tueur dans sa seconde vidéo, les pensionnaires de la maison de retraite où travaille Suzanne sont victimes d’un empoisonnement. Ayant consommé les mêmes médicaments, Suzanne est hospitalisée. Wassermann et Roebuck tentent d’en savoir plus sur la jeune femme et sur son frère, Stephen. Celui que l’on surnomme désormais le "terroriste de lavérité" reprend contact avec Danny. Il lui fait part de sa prochaine cible : les anciens combattants dont la France ne se soucie plus.

Les équipes françaises et britanniques se démènent pour retrouver la trace de Jean-Claude Desplanque. L'ancien soldat, enlevé par le «terroriste de la vérité», est retenu quelque part dans une chambre froide à Calais. Le meurtrier propose un marché à la police : si quatre riches personnalités versent à des oeuvres de charité une somme bien précise, sa victime sera relâchée. L'une d'elles, Charlotte Joubert, découvre alors que son époux, baron de la finance, menait une double vie...

Benji s'apprête à achever sa mission de samouraï. Après avoir décapité un psychiatre dans un hôpital, il fait plusieurs victimes dans la rue, au hasard. Alors qu'il tente de mettre fin à ses jours, le «Terroriste», lui, annonce à Danny sa troisième vérité, qui fustige le manque de prise en charge des malades mentaux. Pendant la discussion, le tueur comprend que Benji est aux mains des services de la police et placé en garde à vue. De leur côté, Karl et Elise cherchent à soutirer des informations sur son commanditaire. Le duo se démène pour parvenir à le faire parler, une tâche qui s'avère particulièrement complexe...

Des éboueurs découvrent le cadavre d'Anthony. Elise et Karl trouvent chez Suze suffisamment de preuves pour émettre un mandat d'arrêt contre Stephen. Leur suspect, lui, a été aperçu sur un ferry à Douvres. Parallèlement, un jeune homme tout juste sorti de prison est brûlé vif dans un centre commercial. Le «Terroriste» énonce sa quatrième vérité, qui vise cette fois la jeunesse sacrifiée...

L'étau de la police se resserre lentement autour du tueur en série. Karl et Elise pensent, enfin, tenir une piste solide. Le véhicule dans lequel le terroriste a pris la fuite, et qui vient d'être retrouvé, appartient à la police. Et ce n'est pas le seul indice qui laisse à penser que le tueur pourrait bien être un membre des forces de l'ordre. Des deux côtés de la Manche, des équipes dressent une liste d'agents, en activité ou à la retraite, qui pourraient correspondre au profil. Bientôt des noms de suspects potentiels sont étudiés avec plus d'attention. Karl et Elise fouillent les dossiers...

Au grand dam de Karl et Élise, la DCRI monte une opération pour capturer Fabien Vincent, leur principal suspect. Alors qu'il venait d'être appréhendé par les services secrets, l'homme parvient à s'échapper. Pour couronner le tout, Karl va devoir s'accommoder de la présence d'Andrea Kerrigan, une ancienne collègue à qui on a confié le soin d'accélérer l'enquête. C'est à présent d'elle qu'il devra prendre ses ordres...

Karl et Elise rassemblent peu à peu les pièces du puzzle. Les preuves incriminent de plus en plus Kieran Ashton, un ancien collègue et ami de Karl. Ce dernier semble perturbé par cette découverte. De son côté, Laura accepte que John la retrouve au zoo, où elle a promis d'emmener ses deux filles. Karl et Elise interrogent une ancienne amie de Zahra, la défunte femme d'Ashton. Elle leur révèle que Zhara entretenait une liaison avec un autre homme...

En rentrant chez lui, Karl découvre qu'Adam a disparu. Le message qu'Elise lui a laissé confirme ses craintes : Adam est parti retrouver une certaine Becky, qu'elle suspecte d'être en réalité le Terroriste. Tandis que la police perquisitionne la maison de John Sumner, ce dernier envoie à Karl des coordonnées GPS. Karl se rend avec Elise jusqu'à l'emplacement indiqué, mais ils ne trouvent qu'une voiture abandonnée et un bracelet appartenant à Adam...

Une année s’est écoulée depuis la mort d’Adam, le fils de Karl Roebuck, assassiné par le serial killer qu’il poursuivait. Trop affecté pour reprendre son travail à la PJ, Karl a intégré une unité en charge des victimes. Élise Wassermann, elle, a récemment été promue commandant de la PJ de Calais, et prend ses nouvelles responsabilités très au sérieux.

Élise et Karl s'intéressent en parallèle à un avion qui s'est écrasé entre la France et l'Angleterre dans des circonstances étranges. L'appareil semble avoir été piraté depuis l'extérieur ; mais cette manœuvre, inédite, n'est possible que si elle est menée avec l'aide d'un individu installé à bord.

Occupés par l'affaire du piratage de l'avion, Elise et Karl décident d'enquêter sur tous les passagers. Mais pour l'heure les indices sont maigres. L'enquête sur l'enlèvement des Fournier dans l'Eurotunnel progresse. La police diffuse le portrait-robot d'une jeune femme suspecte que croit reconnaître Sonny Persaud, un brillant universitaire. Curieuse coïncidence, car ce dernier fut le directeur de thèse de Robert Fournier.

Menés par Robert Fournier, les membres de Defence, le groupuscule nihiliste responsable de la tuerie d'Arras, planifient visiblement une prochaine action violente et spectaculaire. Rosa refuse de donner les infromations qui permettraient aux enquêteurs d'éviter le pire.

Après l'attaque du commissariat de Calais, la police cherche à savoir si Robert Fournier faisait partie du commando. Les deux enquêteurs le traquent sans relâche et sollicitent l'aide de Sonny Persaud, sans doute le seul en mesure de faire parler sa fille. Elise se rapproche d'Eryka, l'assistante du juge Bresson, avec laquelle elle partage l'expérience du deuil, qui n'avait pas embarqué dans l'avion accidenté.

Fournier a trouvé refuge chez Koba, qui pourrait être le cerveau de Defence. L'atmosphère familiale est tendue chez les Roebuck, depuis que Laura soupçonne Karl d'avoir eu une liaison alors qu'il s'agissait d'une sous couverture. Déstabilisé, l'inspecteur britannique reste pourtant concentré sur son enquête. Des connexions troublantes entre différents passagers de l'avion sont bientôt mises au jour ...

Le corps de Fournier, porteur d'un virus hémorragique particulièrement virulent, a été déposé devant le commissariat de Calais. Les pressions du MI6 s'intensifient, mais Karl et Elise décident de passer outre les injonctions des services secrets et concentrent toutes leurs investigations sur Vanessa Hamilton, une organisatrice de mariages, liées à Robert Fournier.

Plus déterminé que jamais, Karl tient tête au MI6 et veut arrêter Koba qu'il juge responsable du piratage de l'avion. Elise se laisse emporter par la passion et perd le contrôle de ses sentiments. Alors que Vanessa Hamilton leur échappe, le "chimiste" semble être la clé de l'affaire, mais Karl et Elise vont devoir prendre des risques considérables pour l'arrêter.

Lorsqu’un bateau de pêche français est retrouvé dérivant dans la Manche, délesté de sa cargaison d’enfants, Karl Roebuck brave les directives de sa nouvelle patronne, Winnie Miles, et recontacte Elise Wassermann. Pendant que le binôme policier s’active sur l’enquête, une mère signale la disparition de ses enfants dans le Kent.

Les trois enfants anglais sont retrouvés au fond d’un container du centre d’immigration. À leurs côtés, une vidéo diffuse l’histoire pétrifiante de la légende du Joueur de flûte. BB et Louise sont appelés à la rescousse dans l’enquête. La réapparition de Charlie Moreau, adolescent disparu huit ans auparavant, provoque une onde de choc chez Élise.

L'enquête prend un nouveau tournant lorsque Winnie Miles reçoit un paquet contenant un rat vivant, accompagné de coordonnées géographiques menant à la dernière victime du "joueur de flûte". Sur les lieux, Karl et Élise identifient les restes d’une messe noire. BB et Louise sont confrontés à un suspect en fuite.

Kiki apporte son aide aux inspecteurs dans leur enquête sur Anton. Alors que Karl lance un appel sur Internet en direction de Lana Khasanovic, Élise se lance dans une reconstitution de l’enlèvement de Charlie. Lorsqu’il apprend que son inspectrice enquête à nouveau sur l’affaire Moreau, Astor Chaput réagit avec violence.

Élise est à nouveau démise de ses fonctions. Le commissaire divisionnaire Olivier Pujol, furieux de la mise à pied de la jeune femme, reprend l’enquête sur l’affaire Moreau. BB découvre des indices concordants dans les disparitions de plusieurs personnes. Karl s’aperçoit qu’Elise a disparue et découvre des traces de sang dans son appartement.

BB remonte la piste du « joueur de flûte » grâce au signalement d’une vieille dame disparue. Anton fait peser sur Karl un chantage odieux, qui met en danger la vie d’Élise.