Le 15 juillet 1995, Angela Arruti, jeune pilote à bord du porte-avions USS Seahawk disparaît en mer. S'agit-il d'un meurtre ou d'un suicide ? Les lieutenants Kate Pike et Harmon Rabb Junior du JAG sont dépêchés sur place pour enquêter...

Au cours de son enquête sur la mort d'Angela Arutti, le lieutenant Harmon Rabb se heurte à un mur de silence. Il rencontre le journaliste qui était chargé d'accompagner l'équipage en Bosnie. Ce dernier menace de faire des révélations sous 24 heures...

Une nouvelle équipière, le lieutenant Meg Austin, et une nouvelle affaire pour Harm. Le sous-marin américain USS Tigershark a été chargé de tester une nouvelle sorte de torpille capable de suivre une cible avant de la couler. Pour ces tests, Dirk Grover, un génie de l’informatique, embarque à bord du Tigershark, mais rien ne se passe comme prévu. La torpille disparaît à cause de Grover qui la redirige vers un bateau de croisière et menace de le détruire si les autorités ne lui remettent pas une rançon de 40 millions de dollars.

Pendant une manœuvre toute une section est tuée par un tir d’artillerie trop court. Le lieutenant Williams, qui a indiqué les positions à bombarder, est le fils d’un homme important. Celui-ci est persuadé que son fils est coupable. Mais selon des bandes enregistrées les coordonnées données par Williams étaient justes. Il prétend avoir voulu protéger un camarade qui serait en fait le vrai fautif.

Pendant une soirée Harm rencontre une jeune femme prénommée Angélique, qui est la femme de l’ambassadeur de Thaïlande. Cette personne lui rappelle une jeune Thaï qu’il avait rencontrée pendant ses jeunes années quand il recherchait son père disparu.

Pendant un vol d'essai, le lieutenant Pendry, ami de Harm, meurt dans un accident avec son Tomcat. Harm et Meg doivent découvrir si l'accident est dû à une erreur du pilote ou à un dysfonctionnement du nouveau système de pilotage...

Un adolescent est abattu par un marine sur le mur de l'ambassade américaine au Pérou. Les représentants du JAG doivent découvrir la vérité alors que la famille de la jeune victime crie au meurtre d'enfant innocent. Le marine responsable s'avère être le petit ami de la sœur de la victime et il se trouve que la jeune fille est enceinte...

Meg et Harm retrouvent Kate sur une base d’armement pour enquêter sur un soldat arrêté pour vol d’armes. Ce dernier réussit à s’évader avec deux autres prisonniers en prenant Meg en otage. Harm et Kate se lancent à la poursuite des fugitifs sans l’accord de leurs supérieurs.

Deux soldats américains sont arrêtés à l'intérieur de la frontière irakienne. L'un des deux est tué. Harm et Meg sont chargés de la défense de l'autre soldat, qui est emprisonné. Sur place, ils espèrent trouver de l'aide auprès d'un allié, « Cimeterre »...

Une marine meurt dans un camp d'entraînement. Meg se fait passer pour une recrue afin de découvrir qui est l'assassin pendant que Harm enquête à découvert pour le JAG. Les principaux suspects sont les sergents instructeurs Carrington et Gonzales, jusqu'à ce que Meg découvre une coupure de presse révélatrice...

Une jeune enfant est enlevée dans de mystérieuses circonstances à proximité d'une base aérienne désaffectée. Son oncle J.D. ne croit pas à l'implication d'une force extra-terrestre, théorie très prisée dans la région. Meg et Harm se rendent sur la base et y trouvent la petite fille...

Un jeune major noir est retrouvé dans le coma sur une plage d'exercices. Devant Harm et Meg venus enquêter, la jeune médecin accuse le capitaine qui commande le bataillon d'être trop violent avec ses recrues noires. Il s'avère que le capitaine est lui-même noir...

Pendant une mission au-dessus de la Bosnie, un F-16 a des problèmes et l'équipage doit s'éjecter. Un hélicoptère serbe leur tire dessus. Pour les protéger, le capitaine Boone abat l'hélicoptère serbe au milieu d'une zone de cessez-le-feu. La cour martiale l'accuse d'avoir agi par esprit de revanche et d'avoir violé un cessez-le-feu. Harm, qui vient d'être promu capitaine de corvette, est chargé de défendre Tom Boone...

Un Tomcat américain est frappé par la foudre lors d'un orage. Cet avion, avec à son bord un logiciel classé top secret, doit effectuer un atterrissage d'urgence à Cuba. Harm, Meg, le capitaine de frégate Krennick, accompagnés du sous-secrétaire d’État, sont chargés de négocier le retour du pilote et de son appareil et d'empêcher que les Cubains mettent la main sur le logiciel. Mais Harm découvre rapidement que le but de la CIA est tout autre...

Un espion s'introduit dans un bureau du Pentagone pour voler l'itinéraire que devrait suivre un mystérieux Shepard. Mais il envoie le fax par erreur au bureau de Meg. Se rendant compte de son erreur, il va le récupérer et tire sur Meg, sous les yeux du capitaine Krennick. Meg est dans le coma et Harm apprend que Shepard est en fait le nom de code de Eltsine.

Parce que son supérieur ne respecte pas l'accord conclu avec son prédécesseur et parce qu'on lui refuse le droit de s'exprimer, un tireur d'élite entraîneur des marines tire sur son colonel qui veut l'envoyer en Bosnie. Harm et Meg sont chargés de l'instruction.

En sautant en parachute au-dessus des Caraïbes, le lieutenant Doug Murdock se noie dans l'océan. Les membres de l'équipe commencent par mentir à Harm et Meg, puis révèlent qu'il s'agissait d'une mission ultra-secrète....

Un colonel des marines enlève son fils, dont il n'a pas la garde. Psychologiquement ébranlé par le sentiment d'avoir abandonné un camarade au Vietnam, il se persuade que son fils est la réincarnation de ce soldat...

Le pilote d'une navette spatiale trouve la mort au cours d'un exercice. Le câble d'une nacelle a été sectionné. Harm soupçonne le remplaçant du pilote d'être à l'origine du sabotage...

Harm est enlevé par les autorités chinoises, qui veulent l'interroger sur une éventuelle intervention des États-Unis en cas d'invasion de Matsu et Quemoy...

Harm enquête sur la mort d'un officier de la Navy qui était chargé du programme ARES, un logiciel de défense. Il est aidé par Kate et le capitaine Brockman. Lorsque le système ARES se révèle défaillant et prend possession des commandes du destroyer, Meg est appelée à la rescousse...

Une jeune lieutenant qui sert à bord du Seahawk est retrouvée assassinée au lendemain d'une permission. L'inspecteur Turkey est chargé de l'affaire aux côtés du JAG. Krennick, Meg et Harm mènent l'enquête.

Harm fait équipe avec le major Sarah « Mac » MacKenzie et le lieutenant Roberts. Avec l'agent spécial Webb, ils enquêtent sur le vol de la Déclaration d'Indépendance. Elle a été volée par le colonel O'Hara, qui se révèle être l'oncle de Mac. Celui-ci a volé le précieux document pour rappeler à la population, et surtout aux responsables politiques, son sens et son esprit.

A l'infirmerie de Groton, dans le Connecticut, un prisonnier est victime d'un empoisonnement alimentaire. Dans la confusion qui s'ensuit, un autre détenu, Jason Magida, en profite pour assommer un garde. Il endosse ensuite son uniforme et prend la fuite. Chargés de l'enquête, le lieutenant Harmon Rabb et le major Sarah MacKenzie apprennent que Magida a provoqué volontairement une épidémie en infectant l'eau potable. Durant sa détention, Magida suivait des cours de biologie par correspondance...

Au cours d'une simulation de tir de missile, un F14 s'abîme dans l'océan. Le pilote, le lieutenant Tess McKee, n'a pas le temps de s'éjecter. Le lieutenant Peter Ayers en réchappe miraculeusement. Tess était une amie de Harmon Rabb, qui apprend sa disparition avec une grande émotion. Chargé de l'enquête, il interroge Ayers à l'infirmerie. Celui-ci raconte que lors de la simulation, Tess devait faire en sorte d'éviter les radars. Ayers a aperçu un flash et le moteur du F14 a explosé. Peter pense que l'appareil a été endommagé par un missile antiradar...

Cinq hommes de la marine, en mission secrète, sont chargés de transporter des explosifs au Pakistan, lorsque des terroristes débarquent, arme au poing, sur leur navire. Les officiers Vic Gorski et Mark Harridan tentent de s'en débarrasser, mais l'officier en chef Greg Connors abat Harridan à bout portant. Il est traduit devant la cour martiale pour meurtre avec préméditation. Le capitaine Harmon Rabb Jr est très étonné lorsque madame Harridan lui apprend que son fils et Connors étaient de bons amis...

Le lieutenant Marilyn Isaacs participe à une cérémonie rituelle à bord du «Seahawk», lors du passage de l'équateur, afin de devenir membre de l'Ancien Ordre des profondeurs...

Harm et Mac enquêtent sur la disparition du fils d'un officier en Irlande du Nord. Ils orientent leurs recherches vers l'IRA...

En faisant leur jogging, l'amiral Chegwidden et le juge Laura Delaney se retrouvent face à un mystérieux bouddha manchot en pierre...

Alors que Harm et Mac survolent le massif des Appalaches, ils sont témoins de l'assassinat d'un garde-chasse perpétré par un groupe de braconniers. A la suite d'une défaillance de leur appareil, ils sont obligés d'atterrir en catastrophe...

La princesse Alexandra participe à une manifestation dans les quartiers de l'OTAN, à Bruxelles. Quand son garde du corps est abattu, un ami roumain réussit à mettre la jeune femme en sécurité...

En Colombie, une équipe de JAG doit s'enfuir en laissant sur place l'un des siens, blessé, alors qu'il tentait d'arrêter un caïd de la drogue...

Lors d'une mission d'entraînement, le caporal-chef Bell perd son sang-froid. Un soldat se lance à sa poursuite et une détonation retentit...

Harm est chargé de plaider pour un SDF, Bauwer, impliqué dans l'attaque d'un magasin vidéo. Celui-ci est intervenu en faveur du caissier agressé par plusieurs skinheads. Mais l'intervention de Bauwer cache en réalité un lourd secret familial...

Le lieutenant Rabb est loin d'imaginer que son habituel footing matinal va se terminer à l'hôpital. Au même moment, Semadar Baruk, un émissaire du gouvernement d'Israël, subit une intervention dans ce même établissement. Soudain, un commando du Hamas investit les lieux...

Alors qu'un navire américain traverse une zone brumeuse, son équipage repère un bateau non identifié à moins d'un mille. Il s'agit d'un destroyer russe, le Vasiliev, qui refuse d'établir un contact radio avec son vis-à-vis. Les deux navires entrent alors en collision...

Il fait nuit sur la plage de Virginia. Robert Felker et Liz Holtz flirtent. La jeune femme se déshabille et se jette à l'eau. Tandis qu'elle se baigne, son amant, resté sur la plage, est assassiné. Le mari de Liz est aussitôt inculpé...

Quand les deux inspecteurs Lonegro et Kochifos montent sur le vieux navire U.S.S. Hornet, ils trouvent plus que ce à quoi ils s'attendaient. Après s'être frayés un passage pour inspecter l'état du navire, ils découvrent un cadavre. Effrayés, ils croient avoir vu un fantôme...

Une jeune femme lieutenant pilote d'hélicoptère, qui a fait la une des magazines, est soupçonnée de fraternisation avec un sous officier.Harm est chargé de sa défense, et est opposé à Mac.

Quand le colonel des marines John Farrow défie l'autorité du Pentagone pour porter secours à ses hommes à Haiti, il est l'objet d'une enquête du JAG. La situation se complique en raison des relations anciennes entre Mac et John Farrow. Lors du procès, l'amiral Chegwidden défend le colonel, pendant qu'Harm et Mac doivent gérer l'accusation.

Un F14 s'écrase, entrainant la mort de deux civils . L'officier commandant la base est l'ancien instructeur d'Harm. Comment Harm va t'il réagir face à son ancien mentor ?

Quand un ancien prisonnier de guerre au Vietnam arrive au JAG pour signaler un meurtre qu'il vient de commettre, Harm fait face à un individu très complexe qui pourait savoir quelque chose sur son père, perdu en mission. Willie a attendu 30 ans pour raconter son histoire à sa manière. En fin de compte, Harm découvre que la victime était le méprisable commandant sadique du camp de prisonniers où Willie avait été emprisonné. Mais ce n'est que le début de l'histoire de guerre incroyablement triste de Willie.

Un F14 armé disparait pendant une tempête. Harm, Bud et Mac enquêtent sur cette disparation . La piste du triangle des Bermudes, favorisée par Bud, est abandonnée quand on découvre que la famille du pilote a été enlevée.

Le major MacKenzie et les lieutenants Rabb et Roberts sont envoyés en mer du Japon pour enquêter sur l'attaque d'un avion de ligne coréen par un chasseur américain. Ils découvrent l'existence d'un espion à bord du porte-avions et tentent de désamorcer la crise qui couve entre les Etats-Unis et la Corée du Nord...

Un lieutenant de la marine risque sa vie pour sauver Lawrence Culbertson, un secrétaire d'Etat. Le lieutenant Harmon Rabb Jr et le major Sarah MacKenzie sont chargés de mener une enquête approfondie sur lui, pour savoir s'il mérite la médaille d'honneur du Congrès...

Après les crashes de deux hélicoptères, survenus dans des circonstances mystérieuses, le lieutenant Harmon Rabb est désigné pour mener l'enquête. Alors qu'elle travaille sur des dossiers peu importants, Sarah MacKenzie entend un flash d'information relatant l'accident...

Le lieutenant Harmon Rabb est accusé de meurtre après avoir été surpris par les agents du FBI dans un entrepôt désert. A côté de lui gisait un corps...

Harm est chargé de la défense de l'officier Elisabeth Lane, accusée d'avoir tué un diplomate turc. Légitime défense ou meurtre ?

Josh Pendry a assisté au meurtre d'un sous officier sur la base d'Andrews. Annie vient chercher de l'aide - et plus - auprès d'Harm.

Un amiral, ancien mentor d'AJ, meurt au cours d'une partie chasse dans le Shenandoah Park. AJ ne croit pas au suicide et demande à Harm et Mac d'enquêter.

Rabb et MacKenzie sont extrêmement déçus lorsque l'amiral Chegwidden leur confie une enquête banale au lieu de les charger d'une affaire sérieuse, à caractère criminel par exemple...

En Floride, un croiseur coule le yacht d'un diplomate sud américain. Mais le fils du diplomate est un trafiquant de drogue. Bud fait la connaissance des parents d'Harriet.

Les vies privée et professionnelle du lieutenant Rabb et du major MacKenzie se retrouvent perturbées par une enquête sur un harcèlement sexuel...

Le lieutenant Rabb et le major MacKenzie sont chargés d'assurer la défense de l'officier Anthony Sevalas, accusé d'avoir battu une prostituée. Après une première rencontre avec l'individu, Sarah est certaine de sa culpabilité...

Alors qu'Annie croit son fils à la pêche avec Harm, celui-ci est en fait à bord d'un bâtiment de la marine, baptisé «Tiger», en compagnie de vingt autres jeunes gens. Josh, qui joue l'officier de bord avec beaucoup de zèle, s'amuse comme un fou. Lorsqu'il dit avoir aperçu un canot de sauvetage en train de couler, personne ne veut le croire...

Dans son appartement, Harm est pris d'un accès de mélancolie, alors qu'il examine de vieilles photographies. Un cliché retient particulièrement son attention : celui d'une jeune femme ressemblant fort au major Sarah MacKenzie...

Le lieutenant Harmon Rabb entend à la radio des commentaires sur le procès du colonel Ronald Vickers, qui doit commencer prochainement. En sortant de chez lui, il reçoit un coup sur la tête...

Dans le désert d'Arizona, un hélicoptère militaire atterrit devant la maison d'Indiens Navajo. Son équipage dépose la dépouille mortelle d'un membre de la famille pour qu'elle puisse l'enterrer selon ses rites. Mais une proche de la victime, un médecin, s'aperçoit que le défunt n'est pas un des leurs...

Le lieutenant Harmon Rabb et le major MacKenzie sont chargés d'enquêter sur les décès de six civils, survenus lors d'un entraînement militaire en Italie, après la collision entre un F14 et un hélicoptère au-dessus d'une station de ski...

Bud Roberts, de plus en plus nerveux, ne sait pas s'il va pouvoir épouser sa fiancée. Il s'apprête à plaider sa première affaire lorsque son père et son frère arrivent sans prévenir...

Harm découvre une photo de son père en compagnie d'agents du KGB prise en Sibérie. Cela confirmerait sa thèse comme quoi son père aurait été transféré en Russie. Bien décidé à comprendre, il part sur place. Mac, qui parle couramment le russe, décide de l'accompagner.

A bord d'un MIG-29, Harm Rabb et Sarah MacKenzie survolent la ville de Beloya, à la recherche du père de Harm. Repéré par les radars de l’aviation soviétique, le MIG est abattu en plein vol...

Le professeur Rin Dubotu est agressé par un homme qui en veut apparemment à sa montre. Un autre individu fait fuir son agresseur afin de kidnapper le professeur. Pour mener l'enquête, Harmon Rabb et Sarah MacKenzie se mêlent aux invités d'une réception donnée à l'ambassade du Soudan. Soudain, des terroristes font irruption et prennent en otage les plus hauts dignitaires présents à la soirée...

Ichiro Higashimori marche sur la plage quand il entend les cris d'une femme. Il tombe sur un Américain en train de molester une jeune Japonaise, qui n'est autre que la fille d'Ichiro. Terry Guitry est rapidement arrêté, et le JAG se rend au Japon pour le défendre car il risque l'emprisonnement à vie...

Durant son séjour en Italie avec sa fille, l'amiral Chegwidden aperçoit deux marins ivres. Alors qu'il laisse sa fille pour réprimander les deux hommes, elle se fait enlever par deux individus...

Rabb et Oakley rendent visite à un homme accusé d'un horrible crime. Le suspect aurait profité de la faiblesse d'un malade mental pour l'obliger à mettre fin à ses jours...

Devant les caméras de ZNN, un marine tire sur un terroriste. Harm est chargé de le défendre, mais au cours du procès, son client change d'avocat pour une civile, ancienne professeur de Mac.

Un pilote de chasse prétend que c'est parce qu'il a entendu la voix de Dieu qu'il n'a pas ouvert le feu sur un appareil irakien qui l'attaquait. Harm et Mac vont étudier ses dires d'un peu plus près.

Harm est détaché auprès de Bobbi qui mène une enquête sur une opération qui aurait entraîné la mort d'américains après un reportage controversé sur ZNN. Pendant ce temps, le passé de Mac resurgit.

C'est la consternation au JAG quand Mac est arrêtée pour le meurtre de son époux. Harm va tout faire pour la défendre, pendant que Mic, nouvellement arrivé, est chargé de l'accusation.

Un avion espion américain, piloté par Keeter, s'écrase dans le désert en Iran. Harm et Mac sont envoyés défendre Keeter accusés d'espionnage, mais leur mission change quand ils découvrent que Keeter ne s'est pas éjecté.

Chloe, une petite fille de 10 ans, fait irruption au quartier général du JAG, annonçant qu'elle est la fille de Sarah MacKenzie. Cette jeune orpheline, qui habite avec son beau-père et l'amie de ce dernier, déclare être maltraitée. Chloe n'a jamais connu son père mais, la veille de Noël, un miracle peut se produire...

Harm et Mac sont chargés d'arrêter trois marins poursuivis pour avoir molesté le patron d'un bar situé sur les docks. Ils découvrent que l'agression était en fait une vengeance...

Trois émissaires de l'ONU, pris en otage par des terroristes, sont exécutés parce que l'officier chargé des secours a enfreint les consignes. Bud et Mac doivent le défendre. Pendant ce temps, AJ est conseiller technique sur un film mettant en scène la Navy.

En plein milieu de la nuit, le lieutenant Harmon Rabb reçoit un coup de fil affolé de Clayton Webb. Mais la communication est interrompue avant que les deux hommes soient parvenus à se comprendre. Le lendemain, Harmon apprend que le corps carbonisé de son ami a été retrouvé sur un cargo. Le choc est dur, mais Harmon veut comprendre ce qui s'est passé...

Au cours d'un exercice d'entraînement en Virginie, le lieutenant Rivers abat accidentellement un adolescent de 14 ans. Les parents, qui considèrent que le gouvernement a assassiné leur fils, réclament justice...

Un sous-marin et une frégate entrent en collision dans les eaux norvégiennes. Le commandant du sous-marin affirme qu'il s'agit d'une bavure, mais les autorités scandinaves sont loin d'être du même avis...

Le corps d'une enfant de 7 ans, battue et étranglée, est découvert sur la base navale du Potomac. Particulièrement horrifiés par ce crime odieux, le lieutenant Harmon Rabb et Sarah MacKenzie sont chargés d'enquêter...

A bord d'un porte-avions, un technicien est accusé de sabotage lorsque le vaisseau, croisant dans des eaux hostiles, perd de sa puissance. Le lieutenant Harmon Rabb et Sarah MacKenzie essaient de découvrir les motivations du saboteur...

Le lieutenant Bud Roberts parvient finalement à être nommé avocat au sein de l'unité du JAG. Avant de prendre ses fonctions, il est tenu de prêter serment. Mais, pour sa première affaire, il est amené à défendre son père. L'officier à la retraite «Big» Bud Roberts est effectivement accusé d'avoir escroqué la marine américaine. Durant sa carrière, il était notamment chargé de l'approvisionnement des navires de l'US Navy...

Alors que son père est sur le point de mourir, le major Sarah MacKenzie replonge dans son passé particulièrement douloureux. Elle constate alors qu'elle éprouve un fort sentiment de haine. Elle est furieuse envers le prêtre qui essaie de la convaincre de pardonner au mourant alors que, par la faute de ce dernier, Sarah a sombré dans l'alcool...

Le lieutenant Harmon Rabb pense qu'il est en train de perdre totalement la raison. Pourtant, il a bel et bien eu une vision de son défunt père lui parlant longuement. Il décide de se confier à une amie psychiatre. Perplexe, elle lui avoue qu'elle soigne un officier atteint des mêmes symptômes. Harmon Rabb trouve la coïncidence plutôt troublante...

L'Amiral Chegwidden fait équipe avec Clayton Webb pour faire évader un agent de la CIA retenu prisonnier par des terroristes en Italie.

Harm pense qu’il est temps qu’il se remette à voler maintenant qu’il a retrouvé sa vision nocturne. Mac et Jordan ne sont pas vraiment enthousiasmées par cette idée. Harriet est sur le point d’accoucher…

Content de son affectation qui n'était pas officiellement entérinée, le lieutenant Harmon Rabb pense de plus en plus sérieusement mener sa carrière au sein de l'unité du JAG. Mais il apprend qu'un ex-membre de la Marine, accusé du meurtre de la petite Annie, a refait surface et menace la soeur jumelle de la défunte...

Alors qu'il patrouille aux abords de la Méditerranée, le lieutenant Buxton décide d'ennuyer le lieutenant Harmon Rabb pour prouver qu'il est le meilleur pilote de l'escadrille. En plein vol, il quitte son cap et crée un incident lors d'une procédure d'approche. Harmon est déterminé à ne pas laisser passer cette nouvelle provocation de Buxton...

L'amiral Chegwidden veut tirer au clair les charges qui pèsent contre le lieutenant Andy Buxton. Mais l'astucieux Buxton demande alors à Harmon et à Brumby de le représenter devant la Cour, obligeant ainsi les deux avocats à travailler ensemble...

Harm jongle toujours entre ses fonctions de pilote de chasse et celles de conseiller juridique. Il réussit un sauvetage spectaculaire mais il prend aussi sur son temps libre pour conseiller un jeune officier juridique inexpérimenté...

De retour au quartier général, Harmon Rabb se voit confier une mission délicate. Le fils du secrétaire général de la Marine est accusé d'avoir désobéi aux ordres et manqué de respect à un officier. Il est traduit devant la cour martiale, et Harmon doit assurer sa défense...

Un caporal, principal témoin d'un viol, reste introuvable après avoir reçu l'ordre de témoigner au procès. Harmon et Bud finissent par le repérer et découvrent pourquoi il a préféré disparaître...

Le Lieutenant McGrane se tue dans un laboratoire alors qu'il pensait s'éjecter d'un avion de chasse. Il faisait partie d'un projet de recherche sur les phénomènes psychiques. Mac et Harm se retrouvent dans un procès centré sur le paranormal...

Bud, l'avocat le moins expérimenté du JAG, a pour mission d'accompagner Raglan, un ancien agent des Forces spéciales, sollicité par le Pentagone pour tester la sécurité des bases militaires américaines. Mais Raglan détourne un sous-marin nucléaire avec Bud à son bord. Harmon est appelé à la rescousse...

Harmon Rabb et Sarah McKenzie sont envoyés en mission au Panamá afin de suivre de près les faits et gestes de l'épouse d'un colonel de la Marine. Olivia est en effet soupçonnée de faire entrer clandestinement de la drogue aux Etats-Unis...

Le lieutenant Harmon Rabb se retrouve devant la cour martiale. En effet, une lettre critiquant le président des Etats-Unis et publiée à la une d'un grand quotidien, a été envoyée depuis son ordinateur. Une organisation connue pour ses vues très conservatrices propose cependant d'assurer sa défense. Harmon accepte immédiatement. De son côté, Bud tente d'identifier le véritable auteur de la lettre...

Le lieutenant Elizabeth Hawkes, une collègue de Harmon Rabb, doit passer en cour martiale après qu'un avion s'est écrasé sur un porte-avions en effectuant un atterrissage. Le capitaine du navire et l'officier supérieur de Hawkes l'accusent, tous les deux, d'être responsable de l'accident...

Comme chaque année, Harm se rend au mémorial du Vietnam sur la tombe de son père. Une femme l’interpelle, Jenny Lake. Elle prétend avoir vu Harmon Rabb Senior la veille de sa disparition...

Mac et Harm mettent en place un tribunal fictif à l’Académie Navale de Iron Forge. Ils utilisent une affaire vieille de dix ans, le cas de l’Artilleur Gregory Riordan, mort dans une explosion à bord du USS Minnesota…

Sarah MacKenzie est contrainte de prendre la défense d'un officier, Kenneth Farmer, condamné à mort pour le meurtre de trois marines. Brumby doit requérir la peine de mort, bien qu'il y soit opposé...

Harm est coincé dans la cale d'un bateau qui est en train de couler. Avec lui se trouvent un marin accusé de meurtre et son gardien. Les heures des trois hommes sont comptées...

Un officier, Kevin Lee, est accusé d'avoir tué un marin australien et d'avoir usurpé son identité il y a 28 ans. Harm va se charger de sa défense alors que Mic est à l'accusation. Mais l'affaire prend un tour plus personnel quand Mac fait son apparition...

Accusé à la fois de désertion et de meurtre, Kevin Lee doit être jugé par un tribunal australien. Mais le procès prend une autre tournure quand sa femme revient sur son témoignage initial...

Un soir, alors qu'il attend un taxi devant un bar fréquenté par la communauté homosexuelle, un ami du sergent Victor Galindez est bousculé involontairement par un jeune homme qui sort d'un bar. Une bagarre éclate et le sergent Galindez vient au secours de son ami. Cet incident lui vaut de graves ennuis...

Harm et Mac doivent enquêter sur des GI's américains qui auraient tirés sur des civils lors de la Guerre de Corée. Tout se complique quand ils sont pris en otage par des coréens dans leur avion...

Harm et Mac se retrouvent face à face au tribunal dans une affaire qui concerne une femme matelot accusée de désertion. De son côté, l'Amiral Chegwidden se charge du dossier d'un de ses anciens camarades...

Mac est chargée de l'accusation d'un instructeur parachutiste après la mort par noyade d'un de ses élèves. Un dossier contenant des informations auxquelles elle n'a pas accès en tant que procureur tombe entre ses mains. Elle l'ouvre...

Prenant de nombreux risques, Sarah MacKenzie accepte d'apporter secrètement son aide à Harmon Rabb. Celui-ci est confronté à maintes difficultés dans une enquête relative à l'agression d'une femme marin...

Un sous-marin américain a été coulé la veille de l'attaque de Pearl Harbor en 1941. Un fouilleur d'épave retrouve le bâtiment. L'Amiral Chegwidden et Harm sont sur l'affaire...

Le Lieutenant Rivers se retrouve une nouvelle fois en Cour Martiale. Il a rossé un membre du Congrès qui prétendait faire partie du Corps des Marines. Curtis explique qu'il traque ceux qui prétendent faussement faire partie des SEALs. Harm est chargé de sa défense...

Harmon Rabb a rouvert une affaire de meurtre vieille de dix ans, mais cette initiative a pour effet de déchaîner la colère de la fille de la victime, en l'occurrence le lieutenant Teresa Coulter...

Mickey, le jeune frère de Bud, est accusé d'avoir commis une imprudence pendant un exercice d'entraînement. Mac, Harm, Bud et même l'Amiral vont unir leurs efforts pour démontrer son innocence...

Les sergents Sergei Zhukov et Dimitri Lakarenko survolent la campagne tchétchène en hélicoptère, lorsque des rebelles les prennent pour cibles. Ils sont alors obligés de faire un atterrissage forcé. Sergei prend le temps de récupérer une photo de Harm avant de s'extraire de l'appareil.

Sergei Zhukov et Harm discutent longuement. Harm doute toujours que le jeune Russe soit son demi-frère, même s'il possède des photos de leur père. Mac souhaite se rendre en Tchétchénie pour rejoindre Harm.

Un navire américain, patrouillant non loin des eaux territoriales cubaines, porte secours à une jeune fille de 13 ans qui tentait de rejoindre les Etats-Unis sur un radeau. Les autorités cubaines, embarrassées par la situation, exigent le retour immédiat de l'adolescente...

Pour échapper à une tempête, un F-14 piloté par le capitaine de corvette Mike Urquiza et le lieutenant Jeff Berke, est obligé d'atterrir au plus vite. Alors que leur atterrissage s'est bien passé, leur avion prend feu quelques minutes plus tard.

En Virginie, un couple en voiture s'arrête sur un pont où une femme semble les attendre. Une bagarre éclate entre l'homme, Andy Kingsley, sa femme Susan Kingsley et sa maîtresse Misty James. Cette dernière tombe et meurt. Harm et Mac vont devoir comprendre ce qui s'est passé.

A la base navale de Norfolk, en Virginie, le Quartier-Maître Elling, et sa femme Fanny sont arrêtés par des agents fédéraux. Fanny est en fait une Princesse de sang et sa famille exige qu'elle rentre dans son pays.

Deux jours d'être nommé Commandant de la sixième flotte, l'Amiral Thomas Boone est accusé par un appel anonyme d'avoir participé, en août 1968, au massacre de civils innocents dans le petit village de Tan Dien, au Vietnam. L'enquête est confiée à Mac mais Harm souhaite y participer.

L'amiral Boone, qui mène des opérations au large de la Virginie, est relevé de ses fonctions par l'amiral Nash. Au quartier général du JAG, Harmon et Mackenzie vont tout faire pour lui éviter la cour martiale...

Harriet, la femme du lieutenant Roberts, accouche d'une petite fille, mais des complications au moment de la naissance entraînent la mort du bébé. Bud accuse le docteur Gettis d'avoir commis une erreur médicale lorsqu'il apprend qu'Harriet présente une tumeur abdominale, que Gettis a ignorée à la dernière échographie...

Alors que le capitaine Curt Hollenbeck attend sa nomination en tant qu'inspecteur général au JAG, il est accusé de harcèlement sexuel sur la personne du capitaine Caitlin Pike, laquelle a travaillé sous ses ordres quatre ans plus tôt...

De retour à la vie civile, l'ex-sergent Daniel Craig voit un père en train de brutaliser son fils. Il s'interpose et flanque une correction magistrale au père violent. Craig est ensuite arrêté pour agression...

Un navire de la Marine Américaine entre en collision avec un navire turc durant un exercice d'entraînement de l'OTAN. L'Amiral Chegwidden est chargé de porter des accusations contre le Commandant du navire américain tandis que Harm et Mac sont chargés de sa défense.

Harm se charge de la défense d'un sergent de la marine, accusé de tentative de meurtre sur son épouse. Son seul espoir d'obtenir l'acquittement est de persuader le jury que, si son client en est arrivé là, c'est à cause d'une prière qu'il a adressée un jour à un aumônier tué au Viêtnam...

Harm et le lieutenant Roberts poursuivent en justice un officier accusé du meurtre de l'un de leurs collègues. Mais lorsqu'une preuve essentielle disparaît du dossier, ils se lancent sur de nouvelles pistes...

Lorsqu'un sous-marin soviétique est détruit, les Russes accusent la marine américaine d'avoir commis une gravissime erreur. Harm, très proche du capitaine Volkonov, se retrouve au centre d'un conflit...

Le sergent Galindez se porte volontaire pour se rendre au Nouveau-Mexique afin d'escorter un héros de la guerre du Viêtnam, accusé de désertion. Mais la vie des deux hommes est menacée par les autorités locales...

Le lieutenant Harmon Rabb et Sarah MacKenzie se rendent à Bahrein, où un destroyer américain a été attaqué par des terroristes. Une jeune Américaine, retrouvée à bord du bateau de ces derniers, dit avoir été kidnappée par les terroristes. Harmon Rabb est chargé d'enquêter, car la jeune femme est soupçonnée de les avoir délibérément aidés...

Harmon est chargé de défendre le lieutenant Michael Roberts, le frère de Bud, accusé d'avoir tué un homme dans un bar lors d'une rixe entre militaires et civils à Mazathan, au Mexique. Harmon doit prouver que Roberts a agi en état de légitime défense...

Clark Palmer, un vieil ennemi de Harm, et le sergent Krohn, accusé d'avoir tenté d'assassiner sa femme, sont tous deux en prison. Ils déclarent avoir eu la vision du père Wiggins, un aumônier disparu au Viêtnam. Palmer affirme que ce dernier lui a confié où se trouve l'individu qui a agressé madame Krohn. Harm ignore qu'il va tomber dans une embuscade...

Au Cap Fear, en Caroline du Nord, à la base aérienne du corps des Marines. Le programme OSPREY consiste à tester les appareils F14. Lors d'un vol d'essai auquel participe Bobbi Latham, membre du Congrès, un incident se produit, blessant légèrement les occupants. Madame Latham porte l'affaire en justice, arguant que les appareils présentent des défaillances mécaniques...

Jordan Parker, une ancienne petite amie de Harm, est retrouvée morte à son domicile. Les premiers éléments indiquant qu'elle a été assassinée, Harm figure sur la liste des suspects...

Pendant la fête organisée pour ses fiançailles avec Mic, Mac s'éclipse avec Harm et tous deux se remémorent le passé...

Sarah Mackenzie doit donner une conférence sur un procès qui a eu lieu en 1842. Les trois meneurs d'une mutinerie ont été condamnés à la pendaison. En préparant ses documents, elle se met à imaginer ses collègues officiers dans le rôle des mutins...

Le mariage de Mac avec Mic approche. Elle se rend compte que ses sentiments pour Harm sont très forts. Harm doit s'absenter pour le week-end. Bientôt Mac apprend qu'il est porté disparu en mer, après un violent orage.

Harm est présumé perdu en mer pendant que les invités du mariage de Mac attendent des nouvelles des secours pour savoir quand les opérations de recherche vont reprendre dans un océan atlantique en pleine tempête. Alors qu' Harm commence à sombrer dans les derniers stades de l'hypothermie, son seul espoir est de contacter ses sauveteurs en s'agrippant à une bouée sonar. Pendant ce temps, Mic ne peut que constater la détresse de Mac qui craint de perdre Harm et il prend une décision au sujet de leur avenir qui pourrait laisser Mac décider seule de son avenir.

Mac part enqêter loin d'Harm dans l'Océan Indien au sujet d'un officier tombé à la mer. Pendant ce temps un ancien ami d'Harm est affecté au JAG et les deux hommes s'opposent sur le dossier d'un avion volé et d'un vol non autorisé.

Un major des marines est accusé de négligence par homicide et Mac et Harm se retrouvent face à face pendant la court martiale. A bord de l'USS Guadalcanal, Mac est chargé de l'accusation d'un major accusé d'homicide par négligence par le commandant du navive. A la grande surprise de Mac, Harm arrive à bord pour défendre le major et essayer de clarifier les choses avec Mac au sujet de leur relation. Mais alors qu'ils se retranchent derrière l'affaire , ils ont du mal à trouver du temps pour discuter de leurs problèmes personnels. Pendant ce tmps, l'amiral Chegwidden doit s'occuper de sa filleule adolescente, qui a fait une fugue.

En Indonésie, le consulat américain est assiégé. Suite au transfert du poste de police local vers le consulat d'un marine américain d'un marine accusé de viol, le consulat se retrouve assiégé par la population locale armée en colère et Mac doit prendre la situation en charge.Quand le commandant du détachement de marines est tué et son adjoint rendu aveugle au cours d'une attaque surprise, Mac se rend compte qu'elle est l'officier le plus gradé et doit organiser l'évacuation d'urgence du consulat pris sous le feu de la population.

Harm enquête sur le meurtre de deux crypto-analystes dans une salle sécurisée et découvre qu'une des victimes est un de ses anciens amis. Pendant ce temps, Mac essaie de savoir si la petite fille qu'elle a laissé en Indonésie est toujours vivante.

Alors qu'il défend un ami accusé de fraternisation avec un officier sous ses ordres, Harm découvre que cet ami a vendu des informations concernant un avion de combat. Harm doit alors prendre une décision : mettre sa carrière en péril, car légalement il n'a pas le droit de faire état de sa découverte puisqu'il en a eu connaissance en travaillant sur une autre affaire, ou malgré tout en rendre compte. Pendant ce temps, Mac essaie d'aider un jeune lieutenant qui veut obtenir la garde de sa fille, confié à un père abusif.

Harm défend un marine, qui en violant les règles de combat a provoqué la mort de six soldats, mais ce marine affirme que les ordres lui ont été donnés verbalement par son officier supérieur. En remontant la chaîne de commandement, Harm arrive à Bobbi Latham.

Des rivalités entre personnes surgissent au JAG quand Mac déclare à Harm qu'elle va le battre au cours d'une course de charité à laquelle participe le JAG. Harm se met dans le pétrin en disant à Mac qu'il lui accorde 3 minutes d'avance.Pendant ce temps, le niveau de testostérone monte quand Gunny et Tiner se disputent pour savoir lequel est le plus en forme, et le lieutenant Singer lance des paris sur qui va être le dernier, ce qui froisse Bud, le "favori".

Le gouvernement chinois prend en otage l'équipage d'un avion espion qui est entré en collision avec un de ses chasseurs. Harm est envoyé en Chine pour négocier la libération de l'équipage et de l'avion, qui est équipé de matériel très secret. Quand Harm retourne enfin sur le porte avion américain avec l'équipage, un des pilots de chasse de l'escorte retourne dans l'espace aérien chinois malgré les ordres...

Harm défend le pilote de chasse qui malgré les ordres est allé bombarder l'avion espion retenu par les Chinois, parce qu'il pensait que c'était la meilleure chose à faire. Sturgis est chargé de l'accusation. Pendant ce temps, Mac enquête sur une affaire de harcèlement sexuel auquel doit faire face un colonel des marines, accusé par une femme officier d'avoir laissé diffuser la cassette de son entraînement dans une émission de Vidéo Gags.

C'est la veille de Noël et l'amiral Chegwidden risque de passer pour un grippe sous quand la Navy doit rassembler des rennes qui se sont aventurés sur une piste d'une base américaine en Finlande. Pendant ce temps Harm et Mac ont sur les bras une jeune femme quartier maître qui doit comparaître pour vol après les fêtes, alors que la prison est fermée.

Les dons de voyance de Mac sont à nouveau utilisés lorsque qu'une femme officier est découverte égorgée sur un parking. Ce qui semblait au départ être une affaire banale d'adultère ayant conduit à un meurtre devient beaucoup plus lorsque Mac a des visions qui l'amènent à enquêter sur une conspiration internationale. Avec Sturgis Turner, Mac suit la piste d'information confidentielles qui conduisent à un possible complot terroriste visant à voler des armes nucléaires en Russie.

Harm se lie d'amitié avec la veuve d'un commando tué pendant que son unité tentait de délivrer d'autres victimes. Pour compliquer le tout, Harm est chargé de défendre l'officier qui commandait le détachement et qui est accusé d'homicide par négligence. Parallèlement, Mac doit défendre AJ, qui a été filmé alors qu'il giflait un lycéen et court le risque de devoir démissionner.

Bud doit choisir son camp entre Harm et Mac.Bud est un des jurés dans un procès où Mac est en charge de l'accusation et Harm de la défense. Harm se retrouve face à Mac dans un procès où il défend un infirmier accusé du meurtre d'un marine pendant un exercice.Quand Bud se retrouve faire partie du jury, se considérant comme un expert, il utilise ses connaissances en droit pendant les délibérations pour aider les jurés à se faire une opinion sur les faits, mais découvre que les choses ne sont pas toujours ce qu'elles semblent être.

Harm et Mac défendent une femme pilote qui a refusé d'obéir aux règles imposées aux femmes en Arabie Saoudite, entre autre le port du voile et l'obligation de toujours sortir accompagnée. Le refus franc du lieutenant Joanne Donato d'être accompagnée par des hommes et de s'habiller de façon traditionnelle provoque une tension dans les relations entre le commandant d'une base américaine et le chef religieux local. Au départ, Mac pense que le lieutenant est un mauvais soldat qui désobéit aux ordres reçus, jusqu'à ce qu'elle soit elle même forceé de se plier aux coutumes locales. Pendant ce temps, le capitaine Turner et Bobbi Latham ont un premier rendez vous agité, qui semble devoir rendre un second rendez vous peu probable, jusqu'à ce que Bud et Harriet interviennent.

Harm et Mac sont envoyés sur le USS Seahawk pour expliquer aux officiers du JAG les nouvelles règles de combat, suite à la fuite de combattants talibans, rendue possible par l'hésitation d'un officier du JAG qui n'avait pas su dire si la cible était légitime. Pendant que Harm est sur le porte avion, le capitaine lui demande de participer aux opérations de bombardement sur l'Afghanistan. L'excitation d'Harm se change en inquiétude quand son avion est gravement touché par un missile ennemi, et risque de se perdre en mer. Pendant ce temps, Singer sabote par jalousie une affaire sur laquelle Bud travaille, quand elle entend parler de sa prochaine promotion.

La tension est grande au JAG quand des accusations de négligence sont retenues contre Bud pour n'avoir pas défendu son client au mieux. Pendant qu'Harm défend Bud, Sturgis est en charge de l'accusation et Bud craint que Sturgis n'ait des preuves accablantes contre lui. Mais quand Bud pense que les choses ne peuvent pas être pires, Sturgis appelle un témoin surprise - Mac - qui à contre coeur doit venir témoigner contre son collègue.

Harm et Mac enquêtent sur un incendie à bord d'un destroyer, provoqué apparemment par un marin qui aurait fumé dans une zone non autorisée. Mais pendant l'enquête, Harm découvre que le matelot est prêt à sacrifier sa carrière pour protéger quelqu'un qu'il considère comme un héros. Pendant ce temps, AJ prend fait et cause pour un vétéran de la seconde guerre mondiale , exclu d'une fonction présidentielle , parce qu'accusé de vol à l'étalage.

Quand le journaliste Stuart Dunston de ZNN fait état de la responsabilité de SEALS dans la mort de civils en Afghanistan, l'opinion publique s'émeut. Mais quand Harm et Mac enquêtent, Harm découvre que Dunston pourrait être à l'origine de l'échec de la mission et ressort une loi oubliée qui lui permet de soumettre Dunston à une court martiale pour avoir désobéi aux ordres du commandant des commandos marines. Pendant ce temps, le lieutenant Roberts reçoit sa feuille de route pour son affectation de 6 mois sur le USS Seahawk.

Un des survivants de la désastreuse explosion de Port Chicago en 1944 demande au SECNAV que les accusations de mutinerie soient retirées de son dossier. Chargé de traiter discrètement le cas, Sturgis découvre qu'une injustice a été commise et affronte le lieutenant Singer au tribunal. Pendant ce temps, Harm aide Harriet à acheter une maison.

La capture de Mustafa Atef, soupçonné d'avoir entraîné les terroristes responsables des attentats du 11 septembre, conduit à mettre en place le premier procès militaire depuis 50 ans, qui se tiendra sur le USS Seahawk. AJ décide de défendre Atef et Sturgis se porte volontaire pour l'assister, pendant que Mac et Harm sont chargés de poursuivre. A la recherche d'un témoin, Mac et Webb se rendent dans un camp de prisonniers en Afghanistan, où une révolte met la vie de Mac en danger.

Harm est chargé de défendre le juge Sebring, accusé d'avoir provoqué un accident qui a entraîné la mort d'un bébé de 6 mois. Pendant ce temps, Webb continue ses recherches pour localiser Kabir, le terroriste d'Al-Qaida en fuite, que l'on a vu pour la dernière fois en compagnie d'un commandant de sous marin russe.

Harm et Mac enquêtent sur des "dommages collatéraux" en Afghanistan quand une attaque menée contre des terroristes d'Al-Qaida a tué trois civils innocents. Avec l'aide du capitaine Coulter, Mac et Harm essaient de déterminer si certains des restes peuvent appartenir à des leaders d'Al-Qaida. Quand Harm et Mac perdent le contrôle de leur véhicule et se retrouvent au milieu d'un champ de mines, ils doivent passer la nuit ensemble à chercher une solution pour se sortir de ce piège.

Les services secrets de la Navy apprennent que le terroriste d'Al-Qaida Kabir Atef, le frère de l'homme que Harm et Mac ont fait condamner pendant un tribunal militaire, prépare une attaque de missile sur la flotte américaine dans l'Océan Indien avec l'aide d'un commandant russe de sous marins connu. Pour éviter le désastre, Mac est envoyée sur le Seahawk, Harm est aux commandes d'un avion de chasse et Turner, un ancien sous marinier qui connaît les tactiques russes est envoyé à bord d'un des sous marins américains. Mais au tout dernier moment, ils apprennent que le missile est porteur d'une tête nucléaire.

Le lieutenant Bud Roberts a été blessé dans l'explosion d'une mine. Il est évacué d'Afghanistan par hélicoptère. Coates l'accompagne...

Harm et Mac sont chargés de défendre le caporal Maars. Il avait déserté son unité de Marines à cause de l'antisémitisme qu'il y avait senti, et rejoint les rangs de l'armée israélienne.

Harm défend un sergent qui dit avoir tué sa femme en état de légitime défense. Mais il refuse que son fils témoigne en sa faveur.

Au moment de l'arrivée à la Navy d'un nouveau secrétaire général, Harm traite une délicate affaire : une nouvelle recrue est accusée d'homicide involontaire...

Harm et Mac enquêtent sur un F-14 ayant eu une défaillance d'oxygène liquide à quarante-cinq-mille pieds.

Le jeune et séduisant lieutenant Kersey accuse de harcèlement sa supérieure, le Commandant O'Neill après un vol au dessus du Pacifique...

La CIA décide de classer le dossier d'une tragédie maritime survenue dans les années 60. Harm, Mac et Turner s'insurgent en mémoire des cent-vingt-neuf hommes morts...

Lorsqu'un exercice de simulation de combat tourne mal, l'amiral Chegwidden appelle le JAG à la rescousse. Le commandant de l'équipe rouge est accusé d'avoir désobéi aux ordres et d'avoir utilisé des armes chimiques, tuant le chef de l'équipe bleue...

A bord du Seahawk, le lieutenant Singer veut poursuivre en cour martiale les personnes qu'elle juge responsables de la mort et de la blessure de deux seconds maîtres. Chegwidden envoie Harm vérifier les faits...

En mission à Naples, Harmon doit collaborer avec Interpol pour débusquer l'auteur d'une série de meurtres de prostituées. Un marine américain est soupçonné...

Coincé la veille de Noël sur l'USS Coral Sea avec l'amiral Boone, Harmon échafaude un plan pour rentrer au pays : les deux hommes échangent leurs places avec deux pilotes de F-14...

Le général Chet Kubin déclare la guerre à la médecine navale quand sa fille Krista meurt des suites d'une opération bénigne...

Après avoir fait des révélations à la presse à propos d'un nouveau casque high-tech, selon lui défectueux, le lieutenant Jeremy Duncan est menacé de cour martiale. Mac est chargée de l'affaire...

Un vieil homme se rend au cimetière d'Arlington sur la tombe d'une infirmière ayant servi pendant la Seconde Guerre mondiale. Il raconte sa vie héroïque à une visiteuse âgée d'une vingtaine d'années...

Un pilote américain est jugé pour avoir bombardé par erreur des troupes britanniques en Afghanistan. Mac, chargée de l'accusation, est soumise à la pression du secrétaire d'Etat à la Marine...

L'Amiral A.J. Chegwidden est accidentellement éjecté d'un avion piloté par Harm. Il disparaît alors qu'une terrible tempête de neige se lève...

A bord d'un sous-marin, un missile portant une tête nucléaire est introuvable lors de l'inventaire. Sturgis est hélitreuillé jusqu'au bâtiment pour y mener l'enquête...

Harm arrive à Norfolk pour défendre son client, accusé d'avoir détourné des fonds de l'US Navy. Il se retrouve pris au piège dans la base pendant que le procès se déroule sans lui...

Harm et Sturgis mènent une enquête sur un vétéran du Vietnam qui aurait fait passer de jeunes travailleuses clandestines aux États-Unis...

Le corps d'un officier de la Marine est retrouvé dans les bois par un jeune scout. Une analyse ADN permet de déterminer qu'il s'agit du lieutenant Loren Singer. Tandis que le NCIS mène l'enquête pour découvrir le meurtrier, Rabb appelle son frère Sergei pour lui apprendre la nouvelle. Interrogé comme les autres membres de l'équipe de l'amiral Chegwidden, Rabb est rapidement considéré comme le principal suspect...

L'agent Gibbs poursuit son enquête concernant le terroriste Amad Bin Atwa. Harm, quant à lui, est traduit en cour martiale pour le meurtre du lieutenant Singer...

Chargés de contrer les plans d'un groupe terroriste, MacKenzie et Webb se rendent au Paraguay, où ils se font passer pour un couple de jeunes mariés...

Harm est très inquiet pour Mac. La jeune femme est toujours en mission au Paraguay avec Clayton Webb. Harm demande à Catherine Gale de l'aider à localiser précisément Mac...

Harm apprend que Mac et Webb ont disparu au Paraguay. La CIA ignore s'ils sont encore en vie. Comme on lui refuse l'autorisation de partir à leur recherche, Harm démissionne du JAG et se rend au Paraguay tenter de les retrouver...

Au Paraguay, Clayton Webb et Mac se retrouvent enlisés dans une mission pour le compte de la CIA associant drogue et terrorisme. Après avoir secouru Harm, Mac l'aide à terminer sa mission : capturer un terroriste. Cela leur donne l'occasion d'évoquer leurs sentiments l'un pour l'autre...

La femme d'un Bédouin est identifiée comme étant Allison LaPorte, un second-maître, disparue depuis 1991 lors de la guerre du Golfe. La jeune femme est accusée de désertion, puis de trahison : Bud est chargé de la défendre. Il s'avère qu'Allison LaPorte est la fille d'un amiral qui travaille pour les services secrets de la marine...

Le nouveau travail de Harm avec la CIA le conduit à Manille. Sa première mission secrète est d'empêcher un terroriste radical philippin de renverser le gouvernement.

En Irak, un enfant d'une dizaine d'années qui gardait ses chèvres surprend une section de marines. Un peu plus tard, les hommes sont attaqués...

Harm et Beth O'Neil sont envoyés en mission en Libye par la CIA. Ils sont chargés de faire sortir un agent du pays en secret. Mais celui-ci veut que sa famille l'accompagne. Pendant ce temps, Mac et Turner s'occupent du cas d'un marin soupçonné de faire partie d'une cellule d'Al-Qaïda...

Harm est renvoyé de la CIA à la suite de l'atterrissage médiatisé du C-130...

En mer du Japon, Turner se retrouve à bord d'un sous-marin américain où dix marins sont atteints du SRAS. La Corée du Sud refuse de les accueillir. Pendant ce temps, Harm, qui a retrouvé sa place au JAG, tente d'aider un vétéran de 80 ans accusé de vol...

Harmon doit défendre un marine qui a commis une infraction grave. En effet, lors d'une prise d'otages que la police tentait de résoudre, le prévenu s'était mis en tête de passer lui aussi à l'action. Un comportement qui contrevient avec l'obligation des militaires de ne pas intervenir dans les affaires de la sécurité civile...

Mac et Bud sont amenés à enquêter sur le récent décès d'un certain Omar Billah. Un soldat de l'armée américaine est accusé du meurtre. Ils découvrent rapidement que ce dossier est plus complexe qu'il n'y paraît...

Mac doit poursuivre un marin accusé de la mort de l'un de ses collègues, tandis que Harm est chargé de défendre ce même homme. De son côté, Mike rencontre la soeur de son colocataire...

Un homme d'affaires menace Mattie Grace d'expulsion. A la demande de l'adolescente, Harm décide de la soutenir. Il tente alors de trouver une solution à ce différend...

En Belgique, le lieutenant Maravalis essaie de vendre un diamant à deux hommes et leur promet de leur en procurer d'autres, s'ils sont intéressés. Mais la transaction ne se passe pas comme prévu...

Sur un quai, deux adolescents découvrent le cadavre d'une femme. A son doigt : la chevalière de l'Académie navale. De son côté, Bud doit assurer la défense d'un capitaine accusé de commettre des vols dans son unité de commandos sous-marins...

Des civils irakiens sont tués lors d'un raid aérien. Le secrétaire d'Etat à la Marine est accusé de violation de la Convention de Genève et de la Charte des Nations unies. Harm, Mac et Bud sont envoyés à La Haye pour défendre le secrétaire qui doit être jugé devant le tribunal pénal...

Après l'accident d'un F18 sur un porte-avions, Harm et Mac mènent l'enquête afin de savoir s'il s'agit d'un suicide. Harmon est amené à piloter le même type d'appareil pour rechercher les causes de l'accident. A Washington, Mattie a de sérieux ennuis...

Mac est nommée procureur pour élucider une affaire de fraude de diamants, directement reliée à Sadik Fahd, le terroriste qu'elle avait recherché au Paraguay. Parallèlement, Harm est devenu sourd à la suite de l'explosion de la batterie de sa voiture. Cet incident pourrait avoir un rapport avec l'affaire dont Mac s'occupe actuellement...

Mac doit faire face aux conséquences psychologiques de la mort de Sadik. Quant à Mattie, elle essaie de gérer la colère qu'elle ressent envers son père...

Et si la vie des membres du JAG avait pris un autre chemin, si Harm avait dit oui à Sarah sur le ferry à Sydney, si Harriet avait refusé d'épouser Bud, si AJ n'était plus au JAG ?

Mac est chargée malencontreusement d'escorter une femme marine jusqu'en Californie où elle doit être détenue. Elle a été reconnu coupable de consommation de drogue. Pendant ce temps, Harm et Bud doivent défendre un quartier maître séropositif qui a du quitter son travail. Il cherche maintenant à le récupérer, mais son supérieur refuse.

Le scandale éclate quand un général des Marines, qui a combattu en Irak, fait, dans une église, l'amalgame entre la religion musulmane et la guerre sainte. Harm et Mac s'affrontent au tribunal...

Lorsque le corps du frère d'une amie de Mattie est retourné à sa famille. Mattie souhaite aider son amie, et demande de l'aide à Harm. Celui-ci va les aider à faire face aux médias.

Une équipe des SEALS accoste un navire contenant une grosse cargaison de drogue. Un paquet est manquant. Harm et Mac enquêtent et travaillent en collaboration avec un agent du MI-6 infiltré. Mac souhaite comprendre le comportement de Webb, elle va donc

C'est l'heure du départ pour l'Amiral qui souhaite changer de vie. Mac apprend des nouvelles inquiétantes sur sa santé, ainsi que la mort de Webb. Mattie va retourner chez son père, Harm se prépare à la voir partir. Harriett a de bonnes nouvelles à partager.

Alors que Mac tente de se remettre de la mort de Webb, l'agent Tanveer refait surface pour lui annoncer que Webb est encore en vie. Mac et Tanveer, bientôt aidés de Harm, vont s'atteler à la tâche pour découvrir le mystère entourant la mort de Webb.

Un marine est tué par un supposé tir ennemi. Sa veuve pense qu'il s'agit d'un meurtre. Au fur et à mesure de leur enquête, Harm et Mac commencent à suspecter un sous traitant militaire privé. Pendant ce temps, Mattie tente de renouer des liens avec son père.

Harm est chargé de défendre un marin accusé du meurtre d'un travesti prostitué 22 ans plus tôt. Pendant ce temps, Bud fait partie d'un jury chargé de trouver un remplaçant à l'Amiral Chegwidden. Le Général Cresswell, un marine qui anime les discussions pour cette candidature va être évalué.

Ca y est la décision a été prise : le nouveau JAG sera le Général Gordon Cresswell. La nouvelle arrive aux oreilles de Mac et Harm, présents à bord d'un destroyer pour régler un conflit entre des pêcheurs canadiens et américains. Mac s'inquiète de son avenir au JAG compte tenu de son passé relationnel avec Cresswell.

Cresswell envoie Harm et Mac à Bagdad pour participer à la court martiale d'un Sergent accusé d'homicide involontaire. La victime n'est autre que le conseiller à la défense Dwight Kanin. Pendant ce temps au JAG, tout le monde découvre que leur nouveau patron n'est pas un enfant de choeur.

La navire de l'Académie Navale est pris dans une tempête avec à son bord un instructeur et ses élèves. Un étudiant est porté disparu. L'instructeur est accusé de manquement au devoir. Mac est chargée de la défense et Sturgis de l'accusation. Pendant ce temps, Harm doit dire au revoir à Mattie qui part revivre avec son père. Mac tente de s'habituer à son nouveau patron, le Général Cresswell.

Au camp de détention Delta, trois gardiens s'en prennent physiquement à un prisonnier, qui est en fait un policier. Cresswell envoie Harm et Mac à Guantanamo pour enquêter. Pendant ce temps à Washington, Bud et son frère, Mickey, font du shopping, quand un des clients du magasin fait des remarques douteuses sur la guerre. Une bagarre éclate. Turner est chargé de la défense dans cette affaire.

Jennifer Coates s'est bâtie une nouvelle vie au JAG. Mais une vieille connaissance débarque à nouveau dans sa vie. Pia, son ancienne partenaire, a besoin de son aide. Coates décide de l'héberger, mais c'était une mauvaise idée. Harm va lui venir en aide.

Une voiture est retrouvée abandonnée sur un pont surplombant le Potomac. Elle appartient à un Capitaine qui travaille au laboratoire de défense d'armes biologiques. La police suspecte un suicide mais le corps a disparu. Harm et Mac rejoignent le FBI pour élucider cette affaire. Pendant ce temps, Bud est chargé de s'occuper du dossier du Caporal Maria Reyes qui souhaite avoir l'autorisation de combattre contre des hommes sur un ring.

La veille de Noël, Mac est transporté à l'hôpital suite à un accident de voiture. Sous l'effet des analgésiques, Mac semble victime d'hallucinations.

Deux F-14 volent bas au dessus d'une route dans le désert lorsque l'un d'eux s'écrase tuant le pilote. Harm est chargé de l'enquête. Pendant ce temps, Mac et Cresswell font leurs exercices de tir obligatoire, ce qui se transforme vite en compétition.

Harm et Mac sont chargés du cas d'un simple soldat accusé du meurtre d'un civil. Ils étaient tout deux impliqués dans un triangle amoureux avec une femme de la même base que le soldat. Coates les accompagne et se retrouve juré. Mac est chargée de l'accusation et Harm de la défense. Autant dire que pour Coates ça ne va pas être une mince affaire.

Harm et Mac sont envoyés en Afghanistan pour enquêter sur un Capitaine des marines qui aurait déserté pour combattre les terroristes à sa manière. Pendant ce temps, Big Bud demande de l'aide à son fils lorsque l'armée veut le rappeler en service actif comme magasinier.

Des marines observent secrètement un village d'Afghanistan, lorsque soudain l'un d'entre eux se lève et fait feu sur l'ennemi. Harm et Mac se retrouvent opposés sur cette affaire.

Mac rencontre un nouveau Lieutenant au JAG, Vukovic. Cresswell veut qu'ils travaillent ensemble sur une affaire. Mais Mac n'apprécie pas les méthodes de travail de Vukovic. Pendant ce temps, Harm fait ses quotas d'heures de vol au dessus du Golf Persique. Mais il se voit forcé d'abattre un avion civil s'il s'approche d'une zone interdite au vol.

Des pirates ont attaqué un cargo birman. Un navire américain prend contact avec le cargo. Mac et Vukovic sont envoyés pour négocier la libération des otages. Pendant ce temps-là, le JAG fait la connaissance de l'épouse du Général Cresswell et de sa fille Cammie, qui fait déjà tourner la tête de Mikey Roberts.

Au Nicaragua, lors d'une mission humanitaire, les familles se jettent sur l'approvisionnement apporté par des marines. Un Caporal entre dans la foule pour aider une jeune fille, il tire une salve en l'air. Et quelques secondes après un homme tombe, mort, à ses pieds. Mac et Vukovic, envoyés à San Diego avec le Général Cresswell, s'affrontent au tribunal. A Washington, Harm apprend que Mattie a eu un grave accident, il se précipite à l'hôpital.

Une fusillade éclate dans une mosquée à Bagdad entre des marines et des insurgés. La scène est filmée par un reporter. Vukovic est envoyé sur place pour défendre un des marines accusé du meurtre d'un civil. A l'hôpital, Harm est au chevet de Mattie. Cresswell demande à Mac de discuter avec Cammie au sujet des femmes dans l'armée.

Trois amis, originaires de la même ville en Oklahoma, sont mobilisés en Irak. Dans leur base, un kamikaze se fait exploser sous une tente. Harm et Bud sont envoyés pour enquêter sur le seul survivant, un des trois amis. Leur voyage les conduit ensuite en Oklahoma pour aider les familles des victimes. Tandis que le seul survivant rentre auprès de sa famille.

Vukovic et le Lieutenant Graves sont envoyés à la recherche des membres de la famille d'un soldat inconnu, mort au Vietnam. Pendant ce temps, Mac et Bud défendent un médecin réserviste de la marine, accusé d'avoir désobéi aux ordres. Harm est chargé de l'accusation.

A bord de l'USS Carl Viinson, deux marins déclenche une bagarre, jusqu'à ce que l'un des deux passe par dessus bord.Vukovic est chargé de la défense du marin survivant. Il demande de l'aide à Harm. Vue leur antipathie réciproque, la chose ne va pas être aisée. Pendant ce temps, Mac doit défendre un marin apprenti qui a libéré de son enclos des dauphins formés par la marine. A la fin de l'épisode, Cresswell annonce une nouvelle qui fera l'effet d'une bombe à nos deux avocats, Harm et Mac.

Le Général Cresswell informe Harm et Mac qu'ils sont réaffectés. Harm est promu au rang de Commandant à Londres et Mac est transférée au JAG de San Diego. Ils ont tous deux la possibilité de prendre l’un des membres du JAG de Washington avec eux et ont tous deux demandé à Bud mais Harriet n’est pas très enthousiasmée par un déménagement. Vu qu’ils n’ont que 3 jours pour régler leurs affaires, Harm et Mac doivent régler leurs affaires et surtout démêler les sentiments qu’ils éprouvent l’un pour l'autre. Ils se remémorent le passé et tout se termine avec un tirage au sort. Pendant ce temps, Vukovic tente de résoudre sa première affaire.