Adrian Toomes se fait voler une de ses inventions par Norman Osborn. Celui-ci devient le vautour pour se venger de lui.

Dans le laboratoire du Dr Connors, Max Dillon est électrocuté accidentellement. Après être hospitalisé, son corps produit de l'électricité en permanence. Les docteurs promettant de lui trouver un remède, Max perd patience et devient un nouveau criminel, Électro.

Le Dr Connors s'injecte de l'ADN de lézard pour faire repousser son bras. L'expérience réussie mais les effets secondaires ne s'avèrent pas mieux.

Hammerhead donne à Montana des gants projetant des ondes soniques et une combinaison dans le but d'éliminer Spider-Man.

Hammerhead transforme Flint Marco en l'Homme-Sable pour éliminer Spider-Man. Spider-man apprend qu'un homme appelé "Le Grand Patron" tente de l'éliminer.

C'est au tour de Alex O'Hurn d'être transformé en Rhino pour éliminer aussi Spider-Man. Dans cet épisode, Spider-man trouve qui se cache derrière le masque du "Grand Patron".

Lors d'une soirée organisée par Thombstone, le Bouffon Vert vient la troubler pour éliminer l'organisateur. Spider-Man se voit obliger de protéger Thombstone pour vaincre le Bouffon Vert.

Otto Octavius voit ses quatre tentatules fusionnées avec son corps. Étant mal traité par Norman Osborn, celui-ci s'attaque à lui. Manquant de batterie, celui-ci tente de se procurer une batterie pouvant tenir pendant plusieurs années. Spider-Man devra l'en empêcher.

Le Bouffon Vert tend un piège à Spider-Man et à Thombstone pour les éliminer tous les deux. Spider-man découvre qui se cache derrière le masque du Bouffon Vert.

Un alien collé sur la navette spatiale de J. Jameson est placé dans le laboratoire du Dr Connors. Spider-Man voulant aller la voir surprend Black Cat sur le point de la voler. La chose se colle sur son costume involontairement. Étant accusé du vol, Caméléon se passe pour lui pour cambrioler d'autres banques.

Hammerhead et Électro libèrent Octopus, Shocker, Homme-Sable, Rhino et Vautour et forment à eux 6 les Sinister Six. Leur but est d'éliminer Spider-Man.

Spider-Man est influencé par le symbiote et se dispute avec plusieurs de ses amis. Il tente de s'en séparer mais cela ne sera pas facile.

Eddie Brock a fusionné volontairement avec le symbiote et deviennent Venom pour éliminer leur ennemi commun : Spider-man.

Un des acolytes du Caméléon devient Mystério pour se procurer du matériel qu'à besoin un certain homme.

Sergei Kravenoff vient en ville pour vaincre Spider-man. Étant donné qu'il a échoué la première fois, il s'injecte de l'ADN de lion et devient ainsi Kraven.

Le grand stratège réunit à nouveau Le Vautour, Electro, L'Homme-Sable, Rhino, Mystério et Kraven pour éliminer Spider-Man.

Le grand stratège kidnappe Gwen Stacy afin que son père leur donne des données haute sécurisé. Spider-Man doit la sauver.

L'Homme-Sable est de retour et veut devenir riche. D'un autre côté, Spider-Man aperçoit Eddie Brock/Venom plusieurs fois.

John Jameson a été irradié par le Symbiote et devient le Colonel Jupiter. Venom est bel et bien de retour et se fait passer pour Spider-man.

Venom révèle en public la double identité de Spider-man mais n'a pas encore de preuves pour le prouver.

Plusieurs criminels tente de s'emparer d'une carte électronique. Mais il s'avère que plusieurs d'entre eux la veulent à tout prix. Spider-man, qui s'alliera avec Rhino pour un temps, devra tout faire pour la détruire.

Ces 3 criminels travaillent pour le Grand Patron afin de voler de l'or. Spider-man doit les arrêter.

La ville s'est transformée en champ de bataille pour les criminels. Spider-man devra mettre un terme à tout cela. À la fin, on assistera au retour du Bouffon Vert.

Mark Allan est endetté. Il décide de rembourser sa dette en devenant un nouveau criminel : Molten-Man.

Spider-Man est envoyé en prison pour tester sa sécurité. Mais le Bouffon Vert prend le contrôle de la prison obligeant Spider-man à se battre contre quasiment tous ses anciens ennemis.

Spider-man veut arrêter le Bouffon Vert et soupçonne Harry Osborn, Norman Osborn et Menken pour être le Bouffon Vert. Ses hypothèses tombent toutes à l'eau. Mais qui se cache derrière le masque du Bouffon Vert ?