Lala, princesse de Deviluke tente d’échapper à des gardes qui veulent la ramener sur sa planète d’origine. Cette dernière utilise donc une de ses inventions pour se téléporter sur une autre planète, la Terre. Elle atterrit dans la baignoire de Yuuki Rito. Dans la soirée, après cette situation très embarrassante, trois gardes surgissent dans la chambre de Rito pour ramener Lala l’extraterrestre sur Deviluke. Rito, conscient de la situation, attrape la main de Lala et s’échappe par le toit. Lors de leur fuite, Haruna Sairenji, la fille dont Rito est amoureux les aperçut.

Lorsque Rito se réveilla, il vit Lala toute dévêtu dans son lit… Pendant la matinée, le quiproquo de la vielle ne cessa d’empirer. Zastin est de la partie (un des gardes qui était venu chercher Lala), il explique à Rito qu’en ayant touché les seins de Lala, ce dernier s’est conformé à la tradition de Deviluke et qu’il s’est donc engagé selon les procédures officielles. Rito est totalement choqué… Mais il n’est pas au bout de ses peines…

Lala est officiellement transférée dans l’école de Rito qui tente de la prévenir qu’elle est une aliène et ne doit pas trop se faire remarquer ou s’exposer devant les autres.

Dans un rêve, Rito est sur le point de faire sa déclaration à Haruna. Seulement lorsqu’il se réveille, Lala est là, nue dans son lit, à croire que c’est devenu une habitude ! Le matin, nous avons droit un briefing sur la nourriture de la famille royale de Deviluke.

Saki Tenjouin, la “Reine” du Lycée se retrouve désormais mise de côté avec l’arrivée de Lala, qui devient tout de suite populaire, elle décide donc de réagir face à cette menace. Aya & Rin, ses deux acolytes, “donnent” à Lala le message de leur Senpai : Lala devra défier Saki pour le concours de Miss Calamité.

Un extraterrestre dénommé "Ghi Bree" débarque sur Terre avec des intentions fermes vis-à-vis de Lala. Remarquant l’attirance de Rito pour Haruna, il prend l’apparence du proviseur du lycée Sainan et ordonne à Haruna de l’accompagner dans la remise du gymnase. Au passage, il laisse le soin à Saruyama d’informer Rito du lieu où ils se trouvent...

Un nouveau prétendant de Lala se déclare : Ren Elsie Jewelria. Déjà toutes les filles sont charmées par le jeune homme excepté la princesse.

Yui Kotegawa, choquée par le comportement de ses camarades, veut rétablir l’ordre et forme le Comité de la Morale Publique chargé d’écarter deux amoureux, confisquer portables…

On retrouve Lala et Rito qui semble être malade, lorsqu’un homme entre dans l’atmosphère et les évite de peu. Lala pense que ce n’est rien et entraîne Rito à l’infirmerie. L’infirmière semble ne pas être présente, Lala change se déguise alors en infirmière pour ausculter Rito lorsque Mikado entre enfin. Rito semblerait avoir une une montée de fièvre qui s’est dissipée mais il semble encore malade lorsqu’il rentre chez lui. L’homme s’écrase prêt d’eux lorsqu’il les interpelle, il connaitrais Lala, ce qui n’est pas le cas de celle-ci jusqu’à ce que Peke lui dit que c’est un Kiraraien.

Rito s’éveille après un rêve sur la belle Haruna aux côtés de Lala qui semble, elle, rêver de Rito…

Une jeune fille aux longs cheveux blonds observe les environs…

Ca y est ! Le jour que Rito attendait le plus est enfin arrivé, le festival sportif ! Il éspère enfin pouvoir briller devant Haruna et lui faire sa déclaration. Malheuresement pour lui, le jour J, il la croise dans un escalier et soulève malencontreusement sa jupe.. Résultat habituel, une bonne claque !

On se retrouve sur une planète où une guerre éclate. Lorsque quelqu’un débarque pour affronter les Camérengiens (des sortes de géants rouges), c’est Gido Lucione Deviluke ! Celui qui règne sans partage sur tout l’univers. Ils sont énormes, géants, ce qui ne l’empêche pas de tous les anéantir !

Pour se détendre et éviter de penser à sa mission impossible, devenir le meilleur homme de l’univers, il part faire du jogging. Se reposant sur un banc dans un parc, il rencontre Haruna promenant Maron, son chien, et discute avec elle.

Un étrange vaisseau-manoir arrive à proximité de la Terre… Nos héros se trouvent dans la piscine du lycée. Par l’arrivée étrange de Zastin, les lycéennes découvrent alors les vraies origines de Lala et en sont ravie. Lala et Rito s’envolent via l’épée de Zastin qui entraine malencontreusement Haruna avec eux. Une urgence impose à Lala d’accueillir Cartoz, Prince de la planète Baroz. Il vient ici pour chasser et devenir le meilleur chasseur de l’univers sur un terrain peu connu de Terre : les Plateaux de Guyane. La chasse des Baroziens n’est pas semblable à celle des Terriens : ils n’ont que des armes blanches et doivent trouver le plus gros gibier par leurs propres moyens ; un véritable défi pour Rito. Déjà arrivé que poursuivit, il rencontre un « petit » tyrannosaure, Ginga Kong (la relève de King Kong), de sublimes Amazones (avec leurs seins biens entiers)… Mais qui sera le meilleur chasseur de l’univers ? C’est Haruna, pour sûr, avec ses yeux larmoyants, elle a dompté Ginga Kong !

Pour la première fois que Lala va au parc aquatique, elle invite avec elle ses amies et son fiancé. Run, lassée de ne pas être perçue par Rito, met tout en œuvre pour que ce dernier la remarque. Pour cela, elle tente de rendre les filles tellement honteuses qu’elles n’oseront plus se montrer devant Rito… Toutes ses tentatives sont vaines et elle se fait prendre par Lala après avoir lâché les piranhas de l’espace mangeant les maillots de bains. Elle se rassasie ensuite gratuitement sur le compte de Motemitsu puis se décide à devenir une idole pour être enfin remarquée par celui qu’elle aime. Elle prend Honekawa-sensei comme maître et s’entraine. Malheureusement, Run n’y arrive pas et désespère. C’est sur l’intervention d’Haruna que Rito part la chercher et la trouve à terre, trois hommes en face d’elle.

Les rumeurs vont bon train au sujet du bâtiment abandonné. Pour vérifier les rumeurs, Lala et ses amies décident de l’explorer et emmène avec elles Haruna malgré elle, sa plus grande peur est les fantômes. Rito attaque un fant- Ombre et se prend un joli punch pour être tombé sur sa poitrine… Yui arrive et dispute la déléguée avant que des voix sépulcrales entament un « Disparaissez ! » assez rhétorique, c’est à ce moment que le sol s’effondre… Puis les horreurs s’enchainent, poursuivis par un piano puis deux squelettes qui se reforment en un œil… Ils s’avèrent en fait que ce sont des extraterrestres chômeurs à qui Mikado va donner du travail. Mais un monstre peut cacher un fantôme !

Lala reçoit un colis en provenance de l’espace. Lorsqu’elle l’ouvre, un animal extraterrestre en sort et tente de la tuer. La bête se retrouve toutefois à terre suite à des maux de ventre, douleurs qui sont en vérité des contractions, l’animal s’avérant être une femelle enceinte...

Fascinée par les sources chaudes suite à un reportage télévisé, Lala décide d’acheminer ces eaux dans le jardin de Rito et construit une machine à forer. Ayant eu vent de cette histoire, Risa, Mio, Saruyama, le docteur Mikado et Ombre dorée débarquent chez Rito. Tout ce petit monde prend place à bord de l’invention de la princesse pour se rendre dans les entrailles de la Terre...

Kyôko Kirisaki est une lycéenne qui combat le mal sous l’identité de Magical Kyôko. Elle est cette fois confrontée au Général Mojack, membre d’Usars, une organisation maléfique qui projette de conquérir la Terre.

Désireux de répertorier dans son guide touristique cosmique des gîtes terriens pour extraterrestres, le rédacteur Kimio sollicite Rito et Lala. Aucun établissement de ce type n’existant sur Terre, Rito décide d’en ouvrir un et ambitionne même d’en faire le meilleur gîte de l’univers.

Ombre dorée se remémore qu’elle est avant tout un assassin et se met en quête d’un travail allant dans ce sens. Pendant ce temps, Yui cherche à imposer ses idées à toute sa classe pour le festival culturel, mais Saruyama intervient. Après avoir consulté ses camarades, celui-ci propose un projet original : l’ouverture d’un animal café.

Jalousant la popularité de Rito auprès de la gent féminine, Saruyama s’endort et se met à rêver qu’il est le seigneur du château d’Edo. Il va alors vivre des péripéties et rencontrer divers personnages du folklore japonais sous les traits de ses amis...

À son réveil, Rito s’aperçoit que Lala s’est une nouvelle fois glissée dans son lit. Il s’énerve contre elle et l’extraterrestre réagit d’une manière qui ne lui ressemble pas du tout. Plus tard, Lala est conduite à l’infirmerie scolaire et le docteur Mikado lui diagnostique un rhume de corot. Cette maladie extraterrestre se caractérise par une légère fièvre accompagnée d’un changement radical de personnalité...

Revenu sur Terre, le roi de Deviluke attend de Rito qu’il tienne son engagement en devenant le plus grand homme de l’univers. Pour ce faire, il lui lance un défi, à savoir, atteindre son vaisseau spatial avant que la nuit ne tombe. En cas d’échec la Terre sera détruite...

Rito cherche à atteindre le vaisseau spatial du roi de Deviluke, mais le parcours est semé d’embûches. Heureusement pour lui, il peut compter sur ses amis, mais sera-ce suffisant pour sauver la Terre de la destruction ?

Rito et Lala prennent le chemin du lycée, mais risquant d’arriver en retard, la princesse de Deviluke utilise le boing-boing warp 2.0, une version améliorée du téléporteur…Rito, Lala, Haruna et Mikan se rendent aux bains publics et y croisent Ombre dorée. Cette dernière va être la cible de chasseurs de primes… Estimant que le nombre d’élèves piétinant l’ordre moral augmente, Yui décide d’instaurer « la semaine de sensibilisation aux bonne mœurs » et ainsi de se montrer encore plus intransigeante…

Suite à un dysfonctionnement du dedial de Lala, des tas d’inventions de la princesse de Deviluke jonchent les couloirs du lycée de Sainan. Haruna ramasse le boing-boing warp et se téléporte accidentellement avec Rito…

Yui n’étant pas venue en cours pour cause de maladie, Rito est chargé d’aller chez elle pour lui remettre des polycopiés. Il va entrer dans sa chambre sans frapper…

En revenant du lycée, Rito et ses amies tombent sur Ombre, alors en pleine lecture de magazines de mode. Mio et Risa décident de relooker la tueuse à gages…

Saki est tombée follement amoureuse de Zastin et n’a de cesse de penser à lui. Désireuses d’aider leur amie, Rin et Aya capturent Rito et lui demandent de faire venir le capitaine au lycée afin que Saki lui déclare sa flamme…

Invités par Saki, Rito et ses amis passent la journée sur une plage privée appartenant aux Tenjôin. Tout se passe bien jusqu’au moment où Saki propose une partie de brise-pastèque…

Rito croise Ombre dans la bibliothèque du lycée et se rend compte qu’elle est souffrante. Il la conduit à l’infirmerie, mais n’y trouve personne. Oshizu lui apprend alors que le docteur Mikado est de repos et Lala propose d’aller directement au domicile du médecin intergalactique…

Haruna est complexée par sa poitrine moins généreuse que celle de Lala. De son côté, Nana en a assez que Momo se moque de ses petits seins. L’« opération gros bonnet » est alors mise sur pied !

Une fête pour le réveillon de Noël se prépare chez les Yûki. Pendant qu’il recherche Ombre pour faire une surprise à Mikan, Rito croise Haruna et la convie à la soirée. Malheureusement pour lui, elle projette de réveillonner avec ses parents…

Sorti se promener avec Céline, Rito rencontre Yui. Alors que tous les trois sont dans un parc, Céline échappe à la surveillance des deux lycéens. Le duo la retrouve en train de boire du cola, une boisson qui va avoir un drôle d’effet sur la petite fille…

Estimant que Momo se rapproche un peu trop de Rito, Mikan lui demande de prendre ses distances, d’autant plus que la princesse a tendance à se rendre la nuit dans la chambre du lycéen. Devenue très méfiante après cette discussion, Mikan décide une nuit de se glisser dans la chambre de son frère pour y surprendre Momo et lui faire la morale…

Haruna a finalement révélé à Lala ses sentiments pour Rito. Tout d’abord surprise, la princesse de Deviluke choisit ensuite de soutenir cet amour sans pour autant faire une croix sur le sien…

Rito Yûki est un lycéen comme les autres... Ou pas. Il est en panique face à la gente féminine. L'arrivée de jeunes et jolies princesses extraterrestres a chamboulé sa vie. Lala, l'aînée, héritière du trône de Deviluke, a choisi de vivre avec Rito en vue de leur prochain mariage. Ses deux petites sœurs jumelles, Nana et Momo, ont également décidé de s'installer chez le jeune couple arrangé.

L'incident au lycée durant lequel Ombre a été attaquée a-t-il affecté cette dernière ? L'inconnu caché derrière cette agression cherche clairement à ce qu'Ombre reprenne sa mission initiale : tuer Rito Yûki. Suite à une promesse de longue date faite par Mikan, Ombre est venue passer la nuit chez Rito. Elle décidé également de s'inscrire dans le même lycée que notre héros. Les occasions pour assassiner le jeune homme semblent augmenter. Que va-t-il advenir de notre lycéen terrorisé par les filles ?

Mea passe à l'attaque, et s'en prend cette fois à Rito. Elle essaie de mieux cerner le jeune adolescent. Mais Ombre la surveille... L'amitié entre Nana et Mea va permettre à cette dernière de se rapprocher du groupe qui entoure Rito. Momo voit en elle une maîtresse potentielle. Mais elle a d'abord une autre fille à dompter pour le harem de Rito...

Ombre a du mal à s'intégrer à la vie lycéenne. Une partie d'elle l'empêche de se faire des amis. La seule personne avec qui elle aime passer du temps est Mikan, la petite sœur de Rito. Cependant, une menace pèse sur Ombre et son avenir sur Terre...

Mea et Ombre cherchent à se comprendre l'une et l'autre. Elles aimeraient pouvoir vivre en tant que sœurs, mais leur passé les rappelle à l'ordre. Nana, voyant Mea tourmentée, fait de son mieux pour que cette dernière se change les idées. Elle se retourne alors vers Rito, qui s'avèrera particulièrement efficace pour redonner le sourire à Mea...

Rito, transformée en Riko, son double féminin, subit les assauts de Momo et Mea qui viennent de développer une nouvelle amitié. Ce dernier retrouve finalement sa forme habituelle. Plus tard Run, l'idole des jeunes, se rend chez la famille Yûki pour se confier à Rito. Momo organise alors un rendez-vous entre les deux protagonistes, avec le projet de les observer, bien sûr. Le rendez-vous semble bien se passer. Mais quel est donc cet aveu que Run tient tant à faire à Rito ?

Pour Momo et Nana, toutes les occasions sont bonnes pour se disputer. Fort heureusement Lala veille sur ses petites sœurs. Momo cherche à avoir plus d'informations sur Mea Kurosaki, et demande de l'aide à l'infirmière, Mlle Mikado. De son côté, Rito, après en avoir découvert un peu plus sur Run, se pose maintenant des questions au sujet de Lala. Il décide de se rapprocher de cette dernière pour en apprendre plus sur son passé...

Mikan commence à s'inquiéter au sujet de Momo. Quel niveau a atteint sa relation avec Rito ? Mikan a peur de perdre sa place privilégiée de petite sœur auprès de Rito. Absorbée par ses pensées, elle se laisse avoir par la chaleur, mais Rin Kujô arrive à point nommé pour s'occuper d'elle. Mikan a trouvé une confidente...

Suite à un petit accident, encore avec une invention de Lala, Rito et Ombre se retrouvent collés main dans la main. Les effets disparaîtront d'eux-mêmes en moins de 24h, mais pour le moment, la tueuse et sa cible vont devoir passer la journée, et même la nuit ensemble...

Ombre et Rito se retrouvent donc seuls, les mains liées, dans une chambre, côte à côte... Momo est intriguée par ce que peuvent faire deux adolescents seuls dans la même pièce, la nuit. Mais Mikan est là pour veiller. Cependant, Ombre s'ouvre à Rito et commence à lui parler de son passé. Le jeune garçon va alors en apprendre plus sur l'assassin censée le faire disparaître...

Ombre et Tearju se retrouvent enfin. Le temps passé séparées l'une de l'autre a détruit la relation qu’elles avaient commencé à bâtir auparavant. Les mots sont peu nombreux, mais pleins de sens. Ombre a toujours aimé Tearju et cette dernière, maintenant professeur dans le lycée d'Ombre, va devoir apprendre à connaître ses camarades..

Momo continue ses recherches sur l'amour afin de créer un harem parfait pour Rito. Elle se pose par ailleurs des questions sur ses propres sentiments. Pourquoi est-elle si attachée à Rito ? Quels sont ses réelles intentions envers le jeune homme ? Elle-même cherche à comprendre... Et pour trouver la réponse, elle va devoir mouiller le maillot...

Une fois de plus, Rito vit une journée agitée : Momo se trouve dans son lit à son réveil, il percute une Lala toute nue, voit sa vie une fois encore menacée par Ombre dorée... Il a également fort à faire avec Momo, qui veut lui constituer un harem pour que toutes les filles qui gravitent autour de lui nagent dans le bonheur.

Au lycée, Rito ramasse une invention qu’a fait tomber Lala et se retrouve accidentellement transformé en souris. Il se met à la recherche de la princesse de Deviluke afin qu’elle lui rende son apparence normale, mais sa nouvelle forme va lui compliquer la tâche et lui causer bien des misères...

Nana surprend Mea en plein combat contre des pirates de l’espace et découvre à cette occasion que son amie dispose d’un pouvoir de transformation. Ayant été démasquée, Mea signale à Nana la fin de leur amitié, qu’elle considère comme factice. Cette décision bouleverse la deuxième princesse de Deviluke...

Accompagné par Momo et Nana, Rito se rend au festival de feux d’artifice de Sainan. Nana part rejoindre Mea, laissant ainsi Rito et Momo entre eux. Tous les deux croisent ensuite des membres du V.M.C, mais souhaitant profiter un maximum de son tête-à-tête avec Rito, Momo leur fausse compagnie.

Rito surprend Céline en train de jouer avec une invention de Lala, la petite fille enclenche l’appareil et Rito voit se matérialiser une Yui qui lui tombe dessus, entièrement nue. Le lendemain, les deux camarades de classe se croisent par hasard dans le train et un gros malaise s’installe suite à l’incident de la veille.

Sollicités par leur père, Rito et Mikan font le ménage dans le studio du mangaka. Momo est également présente pour apporter son aide. Une fois la tâche accomplie, le trio s’apprête à partir, mais Saibai demande à sa fille de rester pour lui faire à manger. Momo et Rito rentrent alors seuls, et la princesse de Deviluke s’imagine pouvoir passer un moment intime avec celui qu’elle aime, mais c’était sans compter l’intervention de Némésis...

Tearju est désormais le professeur principal de la seconde B, la classe des jumelles Deviluke, de Mea et d’Ombre. Cette dernière ne vient plus en cours depuis que Tearju a intégré le lycée et ne compte toujours pas revenir en classe. Rito décide alors d’aller lui parler après les cours afin qu’elle revienne sur sa décision et qu’elle se réconcilie avec la scientifique.

Saki ayant rendu malade ses employés de maison, Rito se rend chez elle afin de travailler comme domestique durant une journée. Il est bientôt rejoint par Momo, Nana, Ombre et Mea. Le lycéen se retrouve à faire le ménage avec Rin, et une fois encore, il se rend involontairement coupable d’un geste déplacé envers elle. Rin le chasse, puis revient le voir un peu plus tard, avec une épée à la main...

Lala cherche à rapprocher Rito et Haruna, mais Peke lui conseille de se focaliser sur sa propre histoire. Mise au courant de la situation, Momo encourage sa sœur aînée à se montrer plus offensive avec Rito en lui témoignant des marques d’affection. Jugeant plus tard que Lala ne va pas assez loin, Momo décide de l’aider à passer à la vitesse supérieure...

Désormais au courant pour le projet harem, Nana est perturbée et se montre résolument contre le plan de sa sœur jumelle. Pendant ce temps, Céline chevauche une invention de Lala destinée à aspirer les déchets. Tout se passe bien jusqu’au moment où le robot se met à dysfonctionner suite à un malencontreux incident...

Constatant qu’Ombre continue d’être distante avec Tearju, Rito et Momo demandent au docteur Mikado des renseignements sur le passé de l’assassin légendaire. Le médecin leur raconte que lors de leur première rencontre, Ombre était blessée, sur les rotules et partiellement amnésique...

Devenue "Darkness", Ombre dorée est à présent dotée d’un pouvoir gigantesque et se montre obscène. Grâce à ses nouvelles aptitudes, elle amène sans mal Rito jusqu’à elle et décide de le tuer pour qu’il vive à jamais dans son cœur...

Grâce au concours d’Oshizu, Mea a réussi à reprendre possession de son corps. Elle est bientôt rejointe par Momo et Nana, et le trio fonce prêter main-forte à une Lala en plein combat contre Darkness. En difficulté dans cet affrontement, la première princesse de Deviluke va tout donner pour sauver Rito et les habitants de Sainan...

Rito décide d’appliquer le plan de Mea, à savoir, se livrer volontairement à des actes obscènes sur Darkness afin qu’elle redevienne Ombre dorée. Parviendra-t-il à mener à bien cette opération qui s’annonce éprouvante pour lui ?